主题:【第六届原创】GCMSSolution 的Microscan功能图解

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安平
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gcMSSolution  Microscan功能图解



    梗概:用图解的办法解释gcMS工作于sim模式下使用microscan的效果

ShimadzugcMS-QP2010Plus 使用gcMSSolution工作站,在工作站MS参数选项中有“微扫描宽度”选项,如下图所示。



按照gcMSSolution手册的解释,当MS工作于SIM模式下,设置一定的微扫描宽度,可以改善分析数据的重现性。

(此参数的设定范围是0 - 1.0u。)

实验验证部分:

为了验证此结论,做了一个同一浓度样品连续进样的重复性实验。使用了1pg/ml的八氟萘样品,SIM方式。在使用微扫描功能和不使用微扫描功能的分析条件下,各自连续进样5次,得到色谱图和数据结果如下。

色谱图比较结果

未使用微扫描,即微扫描宽度设置为0



使用微扫描,微扫描宽度设置为1u



粗略看一下色谱图,使用微扫描宽度的色谱图,重复性稍好。

数据结果的比较。

比较两个系列进样的目标峰峰面积。

未使用微扫描功能的5次进样峰面积为:

43958

40772

39761

37797

38023

峰面积的RSD6.2%

使用微扫描功能,微扫描宽度设定为1u5次进样峰面积为:

18331

18084

17569

17803

17399

峰面积的RSD2.1%

综上实验结果,可以得到如下结论:

使用微扫描功能时,多次进样的相对标准偏差较小,即重复性改善。

理论的推演:

那么为什么使用微扫描,会改善重复性呢?

根据gcMSSolution手册的解释,MSSIM模式下,使用微扫描功能时,在给定的质量数附近做扫描,代替原始数据。(这个方法非常像色谱数据中常用的移动窗口平均法,以此进行数字滤波。其实效果也很类似。)

下面为此方法图示:

注意该峰为质谱峰,x轴是质荷比。



假设某个质谱峰,对于其中的a点,如果在两次进样分析中,由于种种原因,ms的质量轴发生微小偏差,那么a点会移动到b点。两点偏差会较大。

使用微扫描功能时,a点的响应由A区域均值来代替。b点响应由B区域均值来代替,那么两点的偏差会较小。

验算的时候,使用了excel。首先构建一个正态分布数列。然后选点,选定区域。

计算ab相对偏差为14%,使用区域均值后,偏差为5%

但是注意,使用微扫描功能,会损失灵敏度(这个结论也类似色谱的数字滤波的结果)。

如图:



小结:

    gcMSsim模式下使用微扫描功能,可以改善进样数据重复性,降低灵敏度。
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fwonder
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和安捷伦的高分辨扫描不是同一个东西吗?安捷伦的高分辨扫描,据说可以区分相差0.1u的碎片。一直以为滤波效果是来自于高分辨的扫描,把扫描范围缩小以后,剔除了一部分干扰的响应值
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2013/7/15 22:05:26 Last edit by fwonder
马克思的战友
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数据的平行性,设置两个参数是进的同一浓度标液吗?两个设置怎么面积相差几万。用同一浓度标液再用0.5u试试。
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2013/7/15 22:05:43 Last edit by qq469023950
安平
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同一样品,进样量相同。

    设定微扫描,会降低灵敏度的。
suliping0
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原文由 安平(byron1111) 发表:
同一样品,进样量相同。

    设定微扫描,会降低灵敏度的。


请教一下,为什么设定微扫描,会降低灵敏度呢?
wuxu20120406
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zal
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安平
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原文由 fwonder(fwonder) 发表:

和安捷伦的高分辨扫描不是同一个东西吗?安捷伦的高分辨扫描,据说可以区分相差0.1u的碎片。一直以为滤波效果是来自于高分辨的扫描,把扫描范围缩小以后,剔除了一部分干扰的响应值


sim方式,应该和ms分辨率没有关系吧?
fwonder
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和安捷伦的高分辨扫描不是同一个东西吗?安捷伦的高分辨扫描,据说可以区分相差0.1u的碎片。一直以为滤波效果是来自于高分辨的扫描,把扫描范围缩小以后,剔除了一部分干扰的响应值


sim方式,应该和ms分辨率没有关系吧?


有关系,比如设置sim100,那么质谱计数的时候它不会非常精确的截取100.0这一小段,质量数范围99.7~100.7都会算进去。这个微扫描是不是缩小这个截取的范围来达到的。我看你写的东西里面,改变的是色谱,只是拿原始的数据做一个平均处理而已,没有改变原始扫描。而像我说的这样才是改变扫描方式,从而改变原始的采集数据。我认为提高分辨率除噪音是更有价值的。当然我们可能不是在讨论同一个话题,我没看过岛津的说明,安捷伦仪器上面的一些东西也只是听工程师说的,加了一些自己的观点,不一定正确
jiangyz120
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和安捷伦的高分辨扫描不是同一个东西吗?安捷伦的高分辨扫描,据说可以区分相差0.1u的碎片。一直以为滤波效果是来自于高分辨的扫描,把扫描范围缩小以后,剔除了一部分干扰的响应值


sim方式,应该和ms分辨率没有关系吧?


有关系,比如设置sim100,那么质谱计数的时候它不会非常精确的截取100.0这一小段,质量数范围99.7~100.7都会算进去。这个微扫描是不是缩小这个截取的范围来达到的。我看你写的东西里面,改变的是色谱,只是拿原始的数据做一个平均处理而已,没有改变原始扫描。而像我说的这样才是改变扫描方式,从而改变原始的采集数据。我认为提高分辨率除噪音是更有价值的。当然我们可能不是在讨论同一个话题,我没看过岛津的说明,安捷伦仪器上面的一些东西也只是听工程师说的,加了一些自己的观点,不一定正确


这个微扫描就是可以设置SIM的扫描范围而已。  0到1u.

一般考虑峰型,会选择一个质谱峰(1AMU)有10个点(4级质谱),就是可以选择测峰中心周围0到10个点的范围。

如果,只选一个最高点附近的峰值来叠加,色谱峰会更高一些,但是容易受到稳定性要求的限制,重复性变差。
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2013/7/17 9:07:20 Last edit by fwonder
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