主题:【讨论】关于AMDIS的疑问

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yuncld
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看了论坛里AMDIS 的教程,个人认为该功能 的使用依赖于MSL库,如果没有库,AMDIS解卷积功能 就没什么意义了;系统提供的那些库完全不够看,最多也才一千多种物质。实际分析 中,库要怎么建立是个大问题:比如说代谢物检定 ,一张代谢物谱图包含上百种代谢物衍生物,买上百种标品做混标衍生反应再一个个自建库,对于普通课题组根本就不可能。对于代谢组学来说,更多的是看各样品量的相对变化,绝对量多少并不重要;那么人工分析数据时,只要每次积分时选择同样的方式或者相同的提取离子,同一物质的样品差异就能够体现。所以看文献时,发现常常有人写文章说“通过AMDIS分析数据”云云,我很怀疑作者是真是这么分析 ,还是这样写显得高大上了。
该帖子作者被版主 symmacros3积分, 2经验,加分理由:发帖
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symmacros
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如果没有库,AMDIS解卷积功能就大大折扣了。我们一直用Amdis处理数据,我们的香精香料MSL库比较大,有七千多种化合物。文献讲使用Amdis应该是真的。
有雨的夜
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很显然,没有数据库谈分析比较困难,数据库的建立耗时,耗力且需要花很多钱。
外面买的数据库一般都是价格不菲。
行业不同,所需要的库也不一样,通用的数据库虽然条目较多,但是没有针对性,很多条目用不上,而需要的又没有收录。所以很多单位都有自己的自建库,这是需要积累的,只为了一个课题去建立的一个行业的数据库似乎不是很现实
我们也是用Amdis处理数据的,方便快速。
该帖子作者被版主 jimzhu3积分, 2经验,加分理由:参与。
yuncld
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原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
如果没有库,AMDIS解卷积功能就大大折扣了。我们一直用Amdis处理数据,我们的香精香料MSL库比较大,有七千多种化合物。文献讲使用Amdis应该是真的。
好多钱钱啊!
symmacros
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是的,前期工作量很大,购买标样,自己提纯试剂,进样收集谱图,建立数据库。
手机版: 关于AMDIS的疑问
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