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主题：【已应助】子离子离子化状态

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Ins_83adee8c
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发表于：2023/10/20 10:40:24 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
各位老师好，因为最近想做一个化合物质谱 ddMS2 的断裂图谱，查找文献发现很多子离子都是带有加氢或加钠峰的。

但是我发现我的化合物进了 QE 之后用 compound discoverer 分析后子离子是不带加氢峰的（我的化合物分子离子峰就是加氢峰），而是直接在断裂位点带正电，如果加上一个氢的话分子量也不对。


想请问一下各位老师为什么文献里面出现的子例子是有加氢加钠而我的子离子没有加和离子呢？哪种情况是正常或出现的比较多的呢？虽然 compound discoverer 帮我推测了子离子带点位点，但他推测的位点是准确度嘛？谢谢各位老师。
推荐答案：歌名回复于2023/10/20
首先这种都是根据碎裂模式都是根据子离子做的可能性推测，并不一定准确，你有兴趣和有时间的话可以再多找找你关注的这个化合物相关文献，经常会看到不同文章对同一个化合物做的不同断裂推测。
其次同一化合物在不同的仪器、在同一个仪器不同时期离子化 的方式会有所不一样，这根实验环境相关性很大，离子化方式不一样导致碎片离子也会不一样，根据碎片推测的断裂方式也会不一样。
最后这些根据子离子推测的断裂方式都是一种可能性，并不是就一定正确，是可质疑的
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歌名
Ins_eedcdc41
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2023/10/20 12:26:46 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
首先这种都是根据碎裂模式都是根据子离子做的可能性推测，并不一定准确，你有兴趣和有时间的话可以再多找找你关注的这个化合物相关文献，经常会看到不同文章对同一个化合物做的不同断裂推测。
其次同一化合物在不同的仪器、在同一个仪器不同时期离子化 的方式会有所不一样，这根实验环境相关性很大，离子化方式不一样导致碎片离子也会不一样，根据碎片推测的断裂方式也会不一样。
最后这些根据子离子推测的断裂方式都是一种可能性，并不是就一定正确，是可质疑的
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2023/10/20 14:01:29 Last edit by Ins_eedcdc41
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2023/10/20 13:48:38 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
学习学习！！！！
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Ins_83adee8c
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2023/10/20 15:17:15 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 歌名(Ins_eedcdc41) 发表:
首先这种都是根据碎裂模式都是根据子离子做的可能性推测，并不一定准确，你有兴趣和有时间的话可以再多找找你关注的这个化合物相关文献，经常会看到不同文章对同一个化合物做的不同断裂推测。
其次同一化合物在不同的仪器、在同一个仪器不同时期离子化 的方式会有所不一样，这根实验环境相关性很大，离子化方式不一样导致碎片离子也会不一样，根据碎片推测的断裂方式也会不一样。
最后这些根据子离子推测的断裂方式都是一种可能性，并不是就一定正确，是可质疑的
谢谢老师！我还有一个小问题就是我的化合物有没有可能会出现 CD 结果里面出现的情况，即在没有加和离子的情况下碰撞气直接把某条键击碎使其带电呢，还是说所有子离子带电方式也是一定要加上加和离子呢（因为好像确实看原始数据没有看到扫描出可以匹配上的子离子加和离子峰），谢谢老师。
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sdlzkw007
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2023/10/20 15:22:44 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
这个问题有点儿复杂，质谱仪的实现模式不一致，碎片断裂的可能性差别很大，有些时候需要其他的手段进行相互印证。比如核磁共振和质谱联合起来推测化合物的结构和组成。
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歌名
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2023/10/20 15:50:19 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 Ins_83adee8c(Ins_83adee8c) 发表:
谢谢老师！我还有一个小问题就是我的化合物有没有可能会出现 CD 结果里面出现的情况，即在没有加和离子的情况下碰撞气直接把某条键击碎使其带电呢，还是说所有子离子带电方式也是一定要加上加和离子呢（因为好像确实看原始数据没有看到扫描出可以匹配上的子离子加和离子峰），谢谢老师。
M+是常见的离子化方式之一，如果你是有标的，跟你的标去对比就可以，标没问题且样品中跟标加和方式、碎裂方式、RT等一致的话那就不用怀疑，直接用就可以，如果是你自己无标，单纯用CD的结果判定的话这个就需要打一个大大的问号，首先不同实验条件下会影响化合物的加和方式，不同加和方式会响应碎裂方式，让后CD匹配情况可信度也有很大疑问，综合起来的质疑就多
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2023/10/20 15:50:38 Last edit by Ins_eedcdc41
Insm_225995ca
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2023/10/20 18:59:01 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
这个问题有点儿复杂，质谱仪的实现模式不一致，碎片断裂的可能性差别很大，有些时候需要其他的手段进行相互印证。比如核磁共振和质谱联合起来推测化合物的结构和组成。
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木头2013
Ins_5ad81294
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2023/10/20 19:46:37 7楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
进来学习一下
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zyl3367898
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2023/10/22 7:53:00 8楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
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hujiangtao
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2023/10/25 15:53:08 9楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
裂解方式很复杂的，不能一概而论，别人的研究结果可以参考主要还是要结合自己仪器的结果具体分析
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