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原文由 chuanbo(chuanbo) 发表:
MS/MS
构造上讲：三重四极杆质谱原理上很简单，它把三个四极杆在空间上串联起来。但由于离子从第一个四极杆传输向下一个四极杆时会有损失，所以最多只能做MS/MS。离子阱质谱的设计获得了质谱界唯一的Nobel奖，因为它改变了传统的观念，在同一个阱中调节RF电压，来实现时间上的串联。由于没有离子空间传输的损失，所以它可以实现MS/MS、MS3、…MS10。在结构解析、确认中，它的优越性显而易见。不过如果不是科研，离子阱的这个重要优势基本是摆设。
定性
四极杆，大家知道，是不可以储存离子的。而离子阱，给四极杆加了两扇门管进出，所以，可以储存离子，在需要储存离子的场合（比如定性、扫描一个宽质量范围），离子阱的灵敏度要高于四极杆。
因为四极杆一个时间只能让一个离子通过；而离子阱可以储存一段时间的离子，再把离子放出，这些离子就都能被测到了。
所以，我们谈到的定性，不仅仅是获得碎片的信息丰富，还在于：扫描时离子阱可以检测到更痕量的物质、灵敏度更高。
定量
在做定量时，情况就不一样了。离子阱的扫描和SRM的灵敏度是几乎一样的（很多人用离子阱做定量时，干脆就还用全扫描定量）。而对四极杆来说，SRM就意味着所有的时间就扫这一个离子，反而使灵敏度大幅度提高。大家一定印象很深刻，四极杆的SRM比子离子谱图灵敏度要高很多。而且在速度上，两者也是不可同日而语的，四极杆可以1秒采集至少10张定量谱图，而离子阱只能1秒采集1张定量谱图。重现性和线性范围也是制约离子阱用于定量分析的瓶颈。
维护
单四极毫无疑问是使用和维护最简单的。
离子阱相对三级四极杆质谱，仪器调谐、使用和维护都更加容易。
关于上述比较，都是建立在其它条件一样的情况下（比如离子源的离子化效率、离子传输效率都一样）。
根据楼主的情况 可以买两台单四极杆GCMS 或一台三重四极
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