主题：【已解决】保留指数校正库建立出现的问题？

在工作站上粗略看看两个MS文件，似乎正常，但你的质谱扫描范围是从50开始，一部分低于50的离子无法匹配，另外后面的正构烷的分子离子一般相差0.5个单位，有点不准，不知为什么？是不是调谐不好（？），也会影响匹配。有时间我在Amdis上试试，看看是什么原因。

原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
在工作站上粗略看看两个MS文件，似乎正常，但你的质谱扫描范围是从50开始，一部分低于50的离子无法匹配，另外后面的正构烷的分子离子一般相差0.5个单位，有点不准，不知为什么？是不是调谐不好（？），也会影响匹配。有时间我在Amdis上试试，看看是什么原因。

很有可能是调谐不好导致有点偏差，但是两个MS文件第一个（5）在Amdis上只有8min之前的（10min之前的也很准确，之后的就有很大出入了？），第二个（6）在Amdis建立保留指数校正文件很正常，用来分析了以下感觉还可以。
程序升温会有影响吗？我程序升温很快的10℃/min。
C8-C40混标里面有混合物姣姥烷，植烷等！

C8-C40混合5正常啊，参考：

3.228 900.0 100 292 Nonane
5.699 1100.0 100 298 Undecane
7.081 1200.0 100 307 Dodecane
8.755 1300.0 100 270 Tridecane
11.249 1400.0 98 221 Tetradecane
15.254 1500.0 100 173 Pentadecane
21.877 1600.0 100 114 Hexadecane
26.939 1700.0 100 246 Heptadecane
29.163 1800.0 100 292 Octadecane
30.751 1900.0 100 320 Nonadecane
32.037 2000.0 98 339 Eicosane
33.149 2100.0 98 347 Heneicosane
34.152 2200.0 98 350 Docosane
35.076 2300.0 93 353 Tricosane
36.053 2400.0 100 323 Tetracosane
37.202 2500.0 92 292 Pentacosane
38.601 2600.0 93 262 Hexacosane
40.352 2700.0 96 233 Heptacosane
42.571 2800.0 86 193 Octacosane

C8-C40混合6和你一样：

4.935 1100.0 100 320 Undecane
6.239 1200.0 100 320 Dodecane
7.818 1300.0 100 292 Tridecane
9.899 1400.0 98 262 Tetradecane
12.603 1500.0 100 239 Pentadecane
15.935 1600.0 100 221 Hexadecane
19.786 1700.0 100 209 Heptadecane
23.966 1800.0 100 201 Octadecane
28.312 1900.0 100 193 Nonadecane
32.706 2000.0 96 212 Eicosane
35.394 2100.0 98 284 Heneicosane
37.115 2200.0 98 320 Docosane
38.442 2300.0 93 324 Tricosane

原文由 lovehome2008(lovehome2008) 发表:

原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
在工作站上粗略看看两个MS文件，似乎正常，但你的质谱扫描范围是从50开始，一部分低于50的离子无法匹配，另外后面的正构烷的分子离子一般相差0.5个单位，有点不准，不知为什么？是不是调谐不好（？），也会影响匹配。有时间我在Amdis上试试，看看是什么原因。

很有可能是调谐不好导致有点偏差，但是两个MS文件第一个（5）在Amdis上只有8min之前的（10min之前的也很准确，之后的就有很大出入了？），第二个（6）在Amdis建立保留指数校正文件很正常，用来分析了以下感觉还可以。
程序升温会有影响吗？我程序升温很快的10℃/min。
C8-C40混标里面有混合物姣姥烷，植烷等！

程序升温没有影响。

在C17和C18后面有两个非正构烷，Amdis是可以自动识别的。

不知道你的Amdis设置怎么样？

我的设置共你参考：

idenif.
minimum match factor：60
match factor penalties--level---average
maximum penalty: 20, No RI in Library: 10

instrument: threshold: off

原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
不知道你的Amdis设置怎么样？

我的设置共你参考：

idenif.
minimum match factor：60
match factor penalties--level---average
maximum penalty: 20, No RI in Library: 10

instrument: threshold: off

我的设置和你一样啊，我又试了，还是我那样子，不知道为什么！而且发现我后面的峰的时间和你做的保留指数时间不一致！混标5和6都是如此，且混标5只做出8min之前的！
我的
3.222 900.0 100 292 Nonane
5.694 1100.0 100 298 Undecane
7.076 1200.0 100 307 Dodecane
8.749 1300.0 100 270 Tridecane
你的
3.228 900.0 100 292 Nonane
5.699 1100.0 100 298 Undecane
7.081 1200.0 100 307 Dodecane
8.755 1300.0 100 270 Tridecane

后来我终于发现 ，我用NIST05的amdis（2.64）做的保留指数时间与你不一样，用NIST02的amdis（2.1）的做的保留指数时间与你完全一样（混标6），但是混标5无论如何都不行！

原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
不知道你的Amdis设置怎么样？

我的设置共你参考：

idenif.
minimum match factor：60
match factor penalties--level---average
maximum penalty: 20, No RI in Library: 10

instrument: threshold: off

是不是我的ALKANES.CSL文件有问题，在附件里或者你邮箱里！
能否把你的ALKANES.CSL,ALKANES.MSL,ALKANES.CID,发给我一份！

在10.388min校正了一个杂峰，这个杂峰干扰了以后的保留指数的校正！那么这个杂峰怎么才能去掉？

那个杂峰是己烷，我编辑了下ALKANES.CSL，把里面的己烷去掉了，结果就成功建立校正保留指数！
amdis2.1(nist02)
3.228 900.0 100 292 Nonane
5.699 1100.0 100 298 Undecane
7.081 1200.0 100 307 Dodecane
8.755 1300.0 100 270 Tridecane
11.249 1400.0 98 221 Tetradecane
15.254 1500.0 100 173 Pentadecane
21.859 1600.0 100 116 Hexadecane
26.939 1700.0 100 246 Heptadecane
29.164 1800.0 100 292 Octadecane
30.751 1900.0 100 320 Nonadecane
32.037 2000.0 98 339 Eicosane
33.149 2100.0 98 347 Heneicosane
34.152 2200.0 98 350 Docosane
35.076 2300.0 92 353 Tricosane
36.053 2400.0 100 323 Tetracosane
37.202 2500.0 90 292 Pentacosane
38.601 2600.0 93 262 Hexacosane
40.352 2700.0 96 233 Heptacosane
42.571 2800.0 86 193 Octacosane

amdis2.64(nist05)
3.222 900.0 100 292 Nonane
5.694 1100.0 100 298 Undecane
7.076 1200.0 100 307 Dodecane
8.749 1300.0 100 270 Tridecane
11.243 1400.0 98 221 Tetradecane
15.249 1500.0 100 173 Pentadecane
21.854 1600.0 100 116 Hexadecane
26.933 1700.0 100 246 Heptadecane
29.158 1800.0 100 292 Octadecane
30.745 1900.0 100 320 Nonadecane
32.031 2000.0 96 339 Eicosane
33.143 2100.0 98 347 Heneicosane
34.147 2200.0 99 350 Docosane
35.070 2300.0 90 353 Tricosane
36.047 2400.0 100 323 Tetracosane
37.197 2500.0 88 292 Pentacosane
38.595 2600.0 93 262 Hexacosane
40.347 2700.0 96 233 Heptacosane
42.565 2800.0 86 193 Octacosane