主题:【求助】GCMS数据分析时的定性匹配度

浏览0 回复16 电梯直达
勇勇君君
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各位大侠,GCMS的色谱峰很多,数据分析对应谱库时,有的匹配度高>90%,有的很低。高的是不是可以说明含有此物质? 低匹配度是什么原因造成呢?低匹配度是对应另外的物质,没有分离好吗?
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symmacros
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匹配度是一个方面,越高可能性越大,有时候峰得纯度不高,匹配度也低,但可能就是这种物质,另一个关键因素就是保留时间或保留指数也要一致。
千层峰
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要具体分析,有时匹配最高那个,不一定是目标物。。
我是风儿
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杜娘
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不知道这个匹配度怎么计算的,有时候百分之九十几的也不是目标物
symmacros
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原文由 我是风儿(nphfm2009) 发表:
我也感到困惑,那匹配度是什么意思呢?
匹配度是个概率的意义,越高可能性越大,是基于一定的算法的,无法百分之百的准确。
symmacros
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symmacros
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安捷伦的工作站使用PBM检索,属于反向检索。

关于 PBM
PBM 是指基于概率匹配(probability-based matching)的算法,该算法是由康奈尔大学的 Fred McLafferty 教授及其合作者共同开发的一个谱库检索程序。

该算法使用逆谱库检索来验证未知光谱中是否存在参比质谱中的峰。检索过程中忽略其他峰,从而实现对化合物混合物的质谱进行分析。

质谱的各个荷质比 (m/z) 值的出现概率并不相同,因此 PBM 算法同时使用质量值和丰度值来识别参比光谱中最有效的峰。向谱库添加质谱时,系统使用这些峰生成压缩参比光谱,以供 PBM 检索程序使用。

随后,检索程序中的预过滤器会为未知质谱中的每个峰分配有效性,并根据有效性在压缩参比质谱中查找最可能的匹配。程序使用上面提到的逆谱库检索对所选压缩光谱与未知质谱进行比较。当使用默认策略参数时,预过滤器可以将数据库中大约 95% 的化合物直接排除,极大地提高了检索速度。
zhao1hao2985
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匹配度是建立在你得谱图与谱库标准谱图的相似度之间的数学关系,总之越像匹配度越高。但是由于样品的纯度不一定那么高,受到杂质的干扰,匹配度会有误差,尤其是小分子物质,低质核比碎片作为主要碎片时,匹配度可信性会偏低。
要结合保留时间来进行区分,保留时间符合,匹配度较高,才能说是有这个物质。
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有雨的夜
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以前看过这个算法,但是挺复杂的,看了也没记住,主要是的意思就是比对标准谱图和未知谱图的相似性,越像就匹配度越高。
有些物质的谱图比较相近,所以匹配度高也不代表一定就是该物质
燚岚
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似懂非懂,不过我有时候测试的是标准物质,但是PBM检索出的就不是该物质,这也可能是数据库的缺陷吧。
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