主题:【已应助】系统相似性达到多少才可以

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冰饼兵
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各位老师,,有微生物鉴定系统,这个系统的相似性要达到多少才说明确定是某个菌种啊?还有相似性如何解释?
推荐答案:dong3626回复于2022/05/25
你看什么用途吧,其实中国药典2020版里面是有规定的。
见2020版药典第四部,见P504页,
合适的微生物鉴定系统中,试验菌
株与参考微生物的一致性水平通常应大于9 0 % 。若可能,微生物鉴定方法确认所用的挑战微生物应包括非发酵型细菌、棒状杆菌和凝固酶阴性的葡萄球菌等,但其一致性水平可能比较低。
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wuyuzegang
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细菌的一般认为98%一下就可能是新种,97%就基本上可以判断,但要做一下生理生化特征来验证,还有就是细胞化学组分方面的东西。97以下不需要做杂交的。
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2022/5/23 9:58:30 Last edit by dahua1981
JOE HUI
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一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌(当然也有例外,DNA序列仅仅是一个参考指标)。
123
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相似性系数法是通过计算相似性系数SAB值来确定微生物之间的关系。

如果SAB等于1,说明所比较的两菌株rRNA序列相同,两菌株亲缘关系相近,若SAB值小于0.1,则表明亲缘关系很远。
冰饼兵
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dong3626
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你看什么用途吧,其实中国药典2020版里面是有规定的。
见2020版药典第四部,见P504页,
合适的微生物鉴定系统中,试验菌
株与参考微生物的一致性水平通常应大于9 0 % 。若可能,微生物鉴定方法确认所用的挑战微生物应包括非发酵型细菌、棒状杆菌和凝固酶阴性的葡萄球菌等,但其一致性水平可能比较低。
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