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主题：【已应助】系统相似性达到多少才可以

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冰饼兵
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发表于：2022/05/23 08:33:22 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
各位老师，，有微生物鉴定系统，这个系统的相似性要达到多少才说明确定是某个菌种啊？还有相似性如何解释？
推荐答案：dong3626回复于2022/05/25
你看什么用途吧，其实中国药典2020版里面是有规定的。
见2020版药典第四部，见P504页，
合适的微生物鉴定系统中，试验菌
株与参考微生物的一致性水平通常应大于9 0 % 。若可能，微生物鉴定方法确认所用的挑战微生物应包括非发酵型细菌、棒状杆菌和凝固酶阴性的葡萄球菌等，但其一致性水平可能比较低。
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wuyuzegang
dahua1981
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2022/5/23 9:37:33 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
细菌的一般认为98%一下就可能是新种，97%就基本上可以判断，但要做一下生理生化特征来验证，还有就是细胞化学组分方面的东西。97以下不需要做杂交的。
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2022/5/23 9:58:30 Last edit by dahua1981
JOE HUI
xurunjiao5339
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2022/5/23 9:42:28 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌（当然也有例外，DNA序列仅仅是一个参考指标）。
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m3149125
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2022/5/23 10:10:37 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
相似性系数法是通过计算相似性系数SAB值来确定微生物之间的关系。

如果SAB等于1，说明所比较的两菌株rRNA序列相同，两菌株亲缘关系相近，若SAB值小于0.1，则表明亲缘关系很远。
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冰饼兵
m3324084
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2022/5/24 7:28:00 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
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dong3626
dong3626
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2022/5/25 8:29:18 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
你看什么用途吧，其实中国药典2020版里面是有规定的。
见2020版药典第四部，见P504页，
合适的微生物鉴定系统中，试验菌
株与参考微生物的一致性水平通常应大于9 0 % 。若可能，微生物鉴定方法确认所用的挑战微生物应包括非发酵型细菌、棒状杆菌和凝固酶阴性的葡萄球菌等，但其一致性水平可能比较低。
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