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主题：【已应助】新人求助，怎么用QE给蛋白质定性啊

浏览0 回复8 电梯直达
趙庭晟
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发表于：2023/07/25 17:18:55 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我想用QE测试BSA，进样浓度1mg/ml，源参数设置如下


然后得到了这么一个东西


能不能请熟悉QE的大佬指点一下我该怎么设置呢，万分感谢
推荐答案：Leuchi666回复于2023/07/26
质谱定性要靠分子量的，蛋白定性要参考氨基酸序列，最好是跑一下酶切后的BSA，然后去查库（我们是用的BPF），用BSA的理论序列，做一下序列覆盖度这样子，单靠质谱直接定性肯定不行的。
或者是找特征肽段，但是也是要酶切的。
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2023/7/25 18:31:29 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
楼主有标品不？定性的话可以将样品走出来的质谱图与标准品（对照品）走出的质谱图进行对比，还有保留时间出峰是否一致等等
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趙庭晟
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2023/7/25 21:11:42 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 memory光阴(Ins_91d3b22d) 发表:楼主有标品不？定性的话可以将样品走出来的质谱图与标准品（对照品）走出的质谱图进行对比，还有保留时间出峰是否一致等等
这就是标样…
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Leuchi666
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2023/7/26 10:39:26 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
质谱定性要靠分子量的，蛋白定性要参考氨基酸序列，最好是跑一下酶切后的BSA，然后去查库（我们是用的BPF），用BSA的理论序列，做一下序列覆盖度这样子，单靠质谱直接定性肯定不行的。
或者是找特征肽段，但是也是要酶切的。
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hujiangtao
hujiangtao
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2023/7/26 10:55:11 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
先查一些相关文献
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m3036177
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2023/7/27 13:21:24 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
pd软件必不可少
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2023/7/27 23:45:56 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我是做蛋白质组学的  过程很简单的
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2023/8/7 12:05:24 7楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
有软件对液质跑出来的数据进行比对分析，要知道物种
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2023/8/7 12:07:35 8楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
用的什么液相呢？
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