主题:【讨论】求比较热电的Q-exactive和AB的5500Qtrap

浏览0 回复54 电梯直达
kite2005
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如题,谢谢。
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黑子
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不是一个级别的东西!
你说5500Qtrap和5600Q-tof如何比较?

5500QTrap是在三重四极杆质谱的Q3上加了个离子阱的检测器,其还是属于低分辨质谱。主要还是用于定量,定性能力较OrbiTrap、TOF等高分辨质谱差远了。

Q-E是四极杆-傅立叶变换质谱的杂交质谱,属于高分辨质谱。

而且,价格上也不是一个级别的,Q-E比Q-TOF卖的还贵呢,更别提QTrap了。
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pingwang00
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我也在比较着两样,在价格不是问题的前提下,哪一种适合复杂的组织细胞中的大量蛋白质的定量分析。目标做至少100 个以上的蛋白质的同步分析。

5500QTrap 的灵敏度高(号称低于10 attomole),通量大,但因为低分辨率,对共同出峰的杂质抗干扰力弱,有可能定量不准,最遗憾的是在Trap下最高1000 的m/z,虽然ABSCIEX 说,这个范围足可以定性确认肽结构,但我觉得不靠谱。最大的优点是SRM/MRM 软件支持够劲。AB 的网上信息丰富,客户支持很到位,也是亮点。

Thermo 销售人员说, Q-exactive的优点是灵敏度高(LOD号称10 attomole), 使用范围灵活。 它的高分辨率有利于准确定量目标,定量能力要比QTOF 好,但通量好像还是比较低。我最担心的是SRM/MRM 软件支持不够。Thermo 的网上信息不多。

正在等 两家的DEMO测试结果和软件演示。
也请 这里高人指点。
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2012/5/9 15:25:24 Last edit by pingwang00
kite2005
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楼上的分析很到位。我觉得如果测蛋白的话Q-E更适合,毕竟orbi在蛋白质组学方面的应用是遍地开花,要考虑的也就是楼主担心的通量和软件问题。我现在基本排除5500trap,因为其分辨率太低了,觉得更适合一些专门做检测的机构。我现在想比较的是5600Q-tof和Q-E了,都说Q-tof定量不准,这款跟其他的有什么区别呢。

原文由 pingwang00(pingwang00) 发表:
我也在比较着两样,在价格不是问题的前提下,哪一种适合复杂的组织细胞中的大量蛋白质的定量分析。目标做至少100 个以上的蛋白质的同步分析。

5500QTrap 的灵敏度高(号称低于10 attomole),通量大,但因为低分辨率,对共同出峰的杂质抗干扰力弱,有可能定量不准,最遗憾的是在Trap下最高1000 的m/z,虽然ABSCIEX 说,这个范围足可以定性确认肽结构,但我觉得不靠谱。最大的优点是SRM/MRM 软件支持够劲。AB 的网上信息丰富,客户支持很到位,也是亮点。

Thermo 销售人员说, Q-exactive的优点是灵敏度高(LOD号称10 attomole), 使用范围灵活。 它的高分辨率有利于准确定量目标,定量能力要比QTOF 好,但通量好像还是比较低。我最担心的是SRM/MRM 软件支持不够。Thermo 的网上信息不多。

正在等 两家的DEMO测试结果和软件演示。
也请 这里高人指点。
greenspanee
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lavey
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徐好狗
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我老土了,我总是觉得我是QTRAP狂人,经常用四极杆和人家高级货比。。。

搞得我现在我自己都在自己装个QTRAP
pingwang00
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现在出了6500 QTRAP,终于可以不再纠结m/z 范围,50-2000 做 bottom-up 的蛋白质组定量分析 够用了。

那么这个系统的分辨率就要依靠HPLC 部分来提高。请教 UPLC,nano HPLC, micro HPLC, 哪个更配QTRAP 蛋白质组定量分析?
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2012/5/25 16:21:13 Last edit by pingwang00
nosomking
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应该是配置Nano LC吧,而且是2-D的
————————————————————————————————————————————————
原文由 pingwang00(pingwang00) 发表:
现在出了6500 QTRAP,终于可以不再纠结m/z 范围,50-2000 做 bottom-up 的蛋白质组定量分析 够用了。

那么这个系统的分辨率就要依靠HPLC 部分来提高。请教 UPLC,nano HPLC, micro HPLC, 哪个更配QTRAP 蛋白质组定量分析?
happy爱米粒
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原文由 徐好狗(hoggy) 发表:
我老土了,我总是觉得我是QTRAP狂人,经常用四极杆和人家高级货比。。。

搞得我现在我自己都在自己装个QTRAP


这么说,徐老师还是青睐QTRAP啦
happy爱米粒
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原文由 pingwang00(pingwang00) 发表:
现在出了6500 QTRAP,终于可以不再纠结m/z 范围,50-2000 做 bottom-up 的蛋白质组定量分析 够用了。

那么这个系统的分辨率就要依靠HPLC 部分来提高。请教 UPLC,nano HPLC, micro HPLC, 哪个更配QTRAP 蛋白质组定量分析?


分辨率依靠HPLC来提高?这个,只听说过色谱分离度,木听说过分辨率,是一个概念吗?
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