主题:【第十二届原创】NIST检索初学笔记5-自建NIST Search谱库(Library)

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symmacros
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分析者端木花之队发表于:2019/08/29 11:38:00 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
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NIST检索初学笔记5-自建NIST Search谱库(Library)


NIST检索是一款很好检索工具。NistSearch (NIST MS Search 2.0)检索提供谱库检索,图谱解析,同位素计算等多种功能,对质谱检索及解析很有帮助,非常好的质谱工具。
一般是直接使用NIST Search自带的谱库进行检索。本篇分享谱库自建方面的经验。
A.    NIST检索自建库
以安捷伦的demo数据文件的第二个峰为例来说明怎样建立NIST Search library。
1.    从安捷伦工作站调用demo数据文件,点击6.431分钟第二个峰。

图1  demo数据总离子色谱图TIC
 ***************************************************

图2  第二个峰的BPM检索
**************************************************************

进行检索得到相应的化合物信息。

图3  第二个色谱峰的PBM检索结果


***************************************************************
在PBM检索的结果为Biphenyl,CAS号为000092-53-4,分子量154,保留指数(非极性柱)为1367。检索信息备用于NIST Search建库。
.
1.    进入NIST Search
从安捷伦的工作站Spectrum-NIST Search进入NIST Search
或者通过Amdis进入NIST Search。在提取质谱图某处鼠标点击,NIST Library----Go to NIST MS Program。

图4. Amdis进入NIST Search


***********************************************************

图5 NIST检索


*****************************************************
1.    建库
点击NIST检索下面的Library

图6  Library谱库界面


*******************************************************
工具栏的图标依次为Import(导入), Export fromLibrary(从库导出), Export(导出), NewSpectrum(新图谱), Edit Spectrum(编辑图谱), delete Spectrum(删除图谱), Add to Library(增加图谱到谱库), Move to library(移动到谱库), delete Library(删除谱库), Create Library(创建谱库)。
先点击Create Library(创建谱库),创建一个谱库,enter the library name(输入谱库名称),命名为test1。

图7  创建谱库


*******************************************************
Add to Library增加图谱,选择需要加入的谱库。例如test1。

图8 加入图谱
********************************
编辑图谱,点击工具栏的Edit Spectrum(编辑图谱),并输入化合物的信息:
Biphenyl,CAS号为000092-53-4,分子量154。完成后点击add to library(加入图谱到谱库)。CAS号出错不管,点击Y,然后OK就行。

图9 编辑图谱



同样可以加入更多的图谱
其它功能,请参考便捷工具栏的说明。
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原文由 symmacros(jimzhu) 发表:欢迎批评指正!待续
请问AMDIS软件可以在哪下载呀?
symmacros
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原文由 Insm_aefda6b(Insm_aefda6bb) 发表:
请问AMDIS软件可以在哪下载呀?
http://chemdata.nist.gov/mass-spc/amdis/downloads/
小俊俊同学啦
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朱老师,谱库的话,岛津安捷伦仪器都是通用的吧?另外最新谱库更新到几几版了?
symmacros
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原文由小俊俊同学啦(Insm_d5f8a0e5)发表:朱老师,谱库的话,岛津安捷伦仪器都是通用的吧?另外最新谱库更新到几几版了?
安捷伦和岛津自己的工作站的谱库是不通用的。格式不一样。amdis是通用的,amdis导入的nist检索谱库是一样的通用的。
我有好多梦想
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请问安捷伦买的nist库和网页在线查询的nist库 有什么区别嘛?    再问一下各位,我有安捷伦质谱的数据,要是比对库需要多少钱呀
qgp
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symmacros
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原文由 我有好多梦想(Ins_2d624530) 发表:
请问安捷伦买的nist库和网页在线查询的nist库 有什么区别嘛?    再问一下各位,我有安捷伦质谱的数据,要是比对库需要多少钱呀
安捷伦购买的库比较全一下,多一些,一种化合物可能有几个不同实验室的质谱图结果。网页在线的化合物可能要少一些,一种化合物只是提供一张质谱图。从安捷伦或其它代理购买NIST库大致几万元,和版本也有关。
SkytheSg
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收到,试了 可以的哈,就是知道这个自建库怎么在分析数据的时候单独拿来用?
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