主题：【第十三届原创】ChemStation格式谱库和MassHunter格式谱库的转换应用

ChemStation格式谱库和MassHunter格式谱库的转换应用

近期想合并修改一个MS ChemStation格式谱库（XXX.L），发现MS ChemStation自带的谱库编辑器只能一个个逐个打开并进行编辑，比较麻烦，费时间。发现MassHunter所带的谱库编辑器编辑比较方便，和excel一样方便。但只能对Masshunter格式（XXX.mslibrary.xml）进行编辑，无法对XXX.L格式的压缩库进行编辑，也无法另存为XXX.mslibrary.xml格式，均不支持这种功能。仔细看了一下Masshunter谱库编辑器的帮助和其它资料，才得以解决。和大家分享一下流程。

方法是先将XXX.L谱库条目复制到XXX.mslibrary.xml谱库里面，修改条目后另存为XXX.L数据库格式。就可以使用了。注意需要同时打开并使用两个谱库编辑器操作。

打开谱库编辑器，在文件菜单打开XXX.L数据库。



例如打开demo.l数据库。



在化合物表里面任何地方点击鼠标右键，添加需要的列，或进行删除，检索，新建质谱或化合物。



添加谱库需要的列，后面才可以复制这些列了，没有哪个列项目，就无法进行复制那个列等操作。



选定添加列后，确定。



选定需要复制列，复制。



然后另外打开一个谱库编辑器，在谱库编辑器里面新建谱库，例如Test_demo.mslibrary.xml。

不要在原来的谱库编辑器里面新建谱库，可能会无法复制原来的列。



保存。右键点击，然后粘贴。注意在一些化合物数目较大数据库复制—粘贴时候，如果进行多次复制—粘贴操作，例如每次1000个化合物，进行复制—粘贴10次，会把最后一行覆盖。所以需要多重复复制一行或新建立一行，然后粘贴，就避免覆盖了。并且及时保存谱库。



这样就把demo.l数据库转移到新建的Test_demo.mslibrary.xml了，即XXX.L格式转换XXX.mslibery.xml格式。如果无法粘贴，可以回到第一个打开的谱库编辑器里面重新复制，重复选定列复制。



就可以在化合物表里面对列进行编辑，例如把原来ID 1的化合物名称dodacane修改成C12 Alkane。然后保存。



然后把数据库Test_demo.mslibrary.xml另存为Test_demo.L。即XXX.mslibrary.xml转换成XXX.L格式。



这样就把修改后的demo.l返回到MS ChemStation的格式了。就可以在MS ChemStation或MassHunter上面使用已经修改过的谱库了。



用上述方法，省了很多事，节约很多时间。