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主题：【已应助】求助QE和Q-TOF探究非靶向代谢组学，找寻未发现物质

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小高药
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发表于：2023/04/13 23:02:52 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
本人是一个刚刚研一的代谢组学研究的小白，实验室中也没有有经验的学长学姐，有几个问题想向各位大佬求助一下：
1.如果想探究某一类代谢小分子物质的异构体，是使用QE更好，还是Q-TOF更好？（横向研究，并且想定量）
2.如果想探究某一个种类中，有多少种小分子物质代谢，使用QE更好，还是Q-TOF更好？（纵向研究，并且想定量）
3.QE和Q-TOF的不同侧重点在哪里？
推荐答案：歌名回复于2023/04/14
1.如果想探究某一类代谢小分子物质的异构体，是使用QE更好，还是Q-TOF更好？（横向研究，并且想定量）---------------------------------------两个都没差异，对弈小分子异构体研究最好的选择是waters的离子淌度
2.如果想探究某一个种类中，有多少种小分子物质代谢，使用QE更好，还是Q-TOF更好？（纵向研究，并且想定量）-----------------------------QE更棒点，QE的数据库和同级别设备的分辨率更好，但是同类型小分子难点在于分离，否则定量不好做
3.QE和Q-TOF的不同侧重点在哪里？----------------------------------------对于同级别设备简单点说QE分辨率更高，数据丰度更优异，QTOF相对来说优势覆盖范围更广
但其实对于出入门的人来说这些设备基本都能满足
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歌名
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2023/4/14 9:20:06 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
1.如果想探究某一类代谢小分子物质的异构体，是使用QE更好，还是Q-TOF更好？（横向研究，并且想定量）---------------------------------------两个都没差异，对弈小分子异构体研究最好的选择是waters的离子淌度
2.如果想探究某一个种类中，有多少种小分子物质代谢，使用QE更好，还是Q-TOF更好？（纵向研究，并且想定量）-----------------------------QE更棒点，QE的数据库和同级别设备的分辨率更好，但是同类型小分子难点在于分离，否则定量不好做
3.QE和Q-TOF的不同侧重点在哪里？----------------------------------------对于同级别设备简单点说QE分辨率更高，数据丰度更优异，QTOF相对来说优势覆盖范围更广
但其实对于出入门的人来说这些设备基本都能满足
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小高药
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2023/4/14 10:41:38 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 歌名(Ins_eedcdc41) 发表:
1.如果想探究某一类代谢小分子物质的异构体，是使用QE更好，还是Q-TOF更好？（横向研究，并且想定量）---------------------------------------两个都没差异，对弈小分子异构体研究最好的选择是waters的离子淌度
2.如果想探究某一个种类中，有多少种小分子物质代谢，使用QE更好，还是Q-TOF更好？（纵向研究，并且想定量）-----------------------------QE更棒点，QE的数据库和同级别设备的分辨率更好，但是同类型小分子难点在于分离，否则定量不好做
3.QE和Q-TOF的不同侧重点在哪里？----------------------------------------对于同级别设备简单点说QE分辨率更高，数据丰度更优异，QTOF相对来说优势覆盖范围更广
但其实对于出入门的人来说这些设备基本都能满足
好的，谢谢您，我还有几个问题想要求助您，能否给我一定建议：
1.Q-TOF如果要自建补充数据库信息，需要提供多少信息，除了离子碎片，保留时间等信息，还需要什么精细化的信息吗？
2.C18、Amide和T3色谱柱之间的区分点在哪里呢？（因为自身实验室中只有Amide色谱柱，想要探究的不只是极性胺类物质，还有肽类物质。）
3.我看到的文献不止有DDA，DIA采集模式，还有SWATH模式，SWATH目前好像比较针对蛋白质和肽类物质，可以兼顾小分子物质检测吗？
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hujiangtao
hujiangtao
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2023/4/14 11:47:35 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
小分子代谢物的话还是QE分辨率高有优势
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Leuchi666
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2023/4/14 11:57:05 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
1.异构体QE和QTOF都不是很好，可以试下3Q，MRM比较方便一点，定量也更准确一点，但是需要摸方法，楼上说的离子淌度也可以，但是好像比较贵一点
2.3看法基本一致，比较推荐三杆
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歌名
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2023/4/14 14:12:22 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 小高药(Ins_b8603de6) 发表:
好的，谢谢您，我还有几个问题想要求助您，能否给我一定建议：
1.Q-TOF如果要自建补充数据库信息，需要提供多少信息，除了离子碎片，保留时间等信息，还需要什么精细化的信息吗？
2.C18、Amide和T3色谱柱之间的区分点在哪里呢？（因为自身实验室中只有Amide色谱柱，想要探究的不只是极性胺类物质，还有肽类物质。）
3.我看到的文献不止有DDA，DIA采集模式，还有SWATH模式，SWATH目前好像比较针对蛋白质和肽类物质，可以兼顾小分子物质检测吗？
1.Q-TOF如果要自建补充数据库信息，需要提供多少信息，除了离子碎片，保留时间等信息，还需要什么精细化的信息吗？---------------------------------------------------,看你的需求是怎么样的，自建数据是一个比较漫长且成本庞大的活，基于少量样本的数据库很多意义不是很大
2.C18、Amide和T3色谱柱之间的区分点在哪里呢？（因为自身实验室中只有Amide色谱柱，想要探究的不只是极性胺类物质，还有肽类物质。）--------------------------------------------------------------------------------------C18就是最常用的反相柱，AMI的基于HIIC的强极性氨基柱，T3是比C18极性更强一点的反相柱，做肽类的话可以试下AMI，基本只要有氨基，保留都还可以
3.我看到的文献不止有DDA，DIA采集模式，还有SWATH模式，SWATH目前好像比较针对蛋白质和肽类物质，可以兼顾小分子物质检测吗----------------------------这种就是不同的仪器对不同的采集数据模式的不同叫法而已，根据你对应的设备去了解会更好点
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小高药
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2023/4/16 11:11:19 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 Leuchi666(Ins_0bb5bacc) 发表:1.异构体QE和QTOF都不是很好，可以试下3Q，MRM比较方便一点，定量也更准确一点，但是需要摸方法，楼上说的离子淌度也可以，但是好像比较贵一点2.3看法基本一致，比较推荐三杆
好的，谢谢
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Insp_2be455b9
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2023/4/16 11:37:22 7楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
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Insm_225995ca
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2023/4/16 11:44:55 8楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
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手机版： 求助QE和Q-TOF探究非靶向代谢组学，找寻未发现物质
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