主题:【第十六届原创】生物实验中的基础操作—病毒转染及Q-PCR

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生物实验中的基础操作病毒转染及Q-PCR

低表达细胞模型的构建

1. -80°C冰箱取出慢病毒载体冰上融化,将慢病毒用空白培养基稀释为滴度2×108,充分混匀,准备好病毒感染增强液。

2. 将悬浮细胞移入15 mL离心管中,900 rpm,离心8 min,弃去上清,用空白培养基重悬细胞沉淀,并用移液枪充分吹打混匀。取其中500 μL放入细胞计数仪中计数,取出1.5×106个细胞置入新的离心管中。

3. 12孔板中以MOI=15的病毒滴度进行感染,培养16 h

4. 16 h后,在原培养基中加入2 ml 新鲜完全培养基继续培养,72 h后观察荧光。

5. 细胞生长至状态良好,加入2 μg/mL嘌呤霉素筛选至90%以上细胞产生荧光。

荧光实时定量 PCRq-PCR

1. RNA的提取:分别将细胞离心,PBS缓冲液清洗2次,900 r/min 离心8 min,得到细胞沉淀。分别加入1 mL Trizol,用移液枪吸打至细胞完全破裂,加入200 μL氯仿,震荡30 s,室温静置10 min,以有效分离无机相和有机相,随后4 °C12000 g/min 离心15 min。将上清移至高压过的1.5 mL离心管中,加入与上清等体积的异丙醇,轻柔颠倒震荡数次,室温静置10 min,随后4 °C12000 g/min 离心10 min。弃去上清,加入75%无水乙醇,4 °C12000 g/min 离心5 min。弃去上清,沉淀置于冰上自然干燥,

但不可完全干燥。用 30 μL DEPC水溶解总RNA。用NanoDrop One超微量分光光度计进行定量和纯度检测。

2. cDNA 的合成:将混合液轻柔吹打混匀,42 °C2 min

  逆转录体系

试剂名称

使用量

RNase-free ddH2O

to 16 μL

4*gDNA wiper Mix

4 μL

模板 RNA

Total RNA1pg-1 μg

5*HiScript III qRT SuperMix

4 μL

第一步的反应液

16 μL



3. q-PCR 检测 mRNA 的表达

GAPDH 引物序列:

Forward primer:5’-GGTCGGAGTCAACGGATTTG-3’

Reverse primer:5’-ATGAGCCCCAGCCTTCTCCAT-3’

ODC1 引物序列:

Forward primer: 5-ATTAAAGGAACAGACGGGCTC-3

Reverse primer:5-ATGTGCGTGGTCATAGAGTATG-3

q-PCR 反应体系:

q-PCR反应体系

试剂名称

使用量

2*ChamQ Universal SYBR qPCR Master Mix

10 μL

Primer110μM

0.4 μL

Primer210μM

0.4 μL

Template DNA/cDNA

X μL

ddH2O

To 20 μL



将混合液轻柔吹打混匀,37 °C, 15 min85 °C, 5 s,得到cDNA

q-PCR反应程序

反应步骤

反应温度

反应时间

循环次数

预变性

95 °C

10 min

1

变性

95 °C

10 s

 

退火

55-65 °C

10 s

30

延伸

72 °C

30 s

 


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