主题：【求助】什么是PBM检索？

原文由 damoguyan 发表:
我用NIST谱库，一般就双击右键查看化合物的结构，匹配度等信息，但好像好像还有个什么PBM检索，不知道用来干嘛的？高手指点一下。

参考：http://www.instrument.com.cn/bbs/shtml/20070911/976326/

原文由 damoguyan 发表:
我用NIST谱库，一般就双击右键查看化合物的结构，匹配度等信息，但好像好像还有个什么PBM检索，不知道用来干嘛的？高手指点一下。

错了，参考：http://www.instrument.com.cn/bbs/shtml/20081118/1591557/

原文由 yaoguoting 发表:

原文由 damoguyan 发表:
我用NIST谱库，一般就双击右键查看化合物的结构，匹配度等信息，但好像好像还有个什么PBM检索，不知道用来干嘛的？高手指点一下。

错了，参考：http://www.instrument.com.cn/bbs/shtml/20081118/1591557/

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感谢！！！！11

pbm就是你的这种检索方法！

PBM=probability-based matching

PBM 是根据概率匹配 (probability-based matching) 算法。它是由 Fred McLafferty 教授及其合作者在 Cornell 大学开发的一种谱库检索程序。

这种算法使用反向检索来检验未知谱中是否含有参照谱中的峰。未知谱中多余的峰被忽略，因此可以进行多种化合物的混合物谱图解析。

由于质谱中各种质荷比 (m/z) 值出现的几率不同，PBM 算法同时利用质量数和丰度值来确认参照谱中最显著的峰。谱图加入谱库后，这些峰用来产生用于 PBM 检索例程的压缩参照谱。

然后检索例程中的预过滤器给未知谱中每个峰赋以显著的值，用来查找压缩参照谱库中最可能的匹配。接着使用上述的反向检索将所选的压缩谱同完整的未知谱进行对比。预过滤器可以立即排除数据库中约 95% 的化合物，从而大大加快了检索速度（使用默认策略参数时）。

PBM Search（搜索）是将未知化合物光谱同参比光谱库比较的一种谱库搜索。MSD 化学工作站的搜索步骤使用由 Cornell 大学的 Fred McLafferty 教授及其合作者开发的根据概率匹配（PBM）算法。通过检验参比光谱中的主要峰是否出现在未知物光谱中，搜索从与未知化合物光谱最相似的参比谱库中识别这些光谱。这种算法称作逆搜索。即使样品光谱包含共洗脱化合物时，它也能在谱库中找到光谱。特殊相似性由一种称作匹配质量的量度来评定。

PBM Search
PBM Search is a library search compares the spectrum of an unknown compound against a library of reference spectra. The search procedure on the MSD ChemStation uses the probability-based matching (PBM) algorithm developed by Professor Fred McLafferty and co-workers at Cornell University. The search identifies those spectra from the reference library that are most similar to the spectrum of the unknown compound by verifying that the main peaks in a reference spectrum are present in the unknown spectrum. This algorithm is called reverse-search and allows spectra to be found in the library, even when the sample spectrum contains coeluting compounds. Spectral similarity is measured by a quantity called match quality.

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jimzhu 好牛！