主题:【第二届原创大赛参赛作品】AMDIS自动化质谱图解卷积和鉴定软件在GC/MS数据处理的初步应用

浏览0 回复247 电梯直达
symmacros
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原文由 lllll01210810(lllll01210810) 发表:
感谢LZ!请问是否有比较详细的AMDIS中文说明书呢 谢谢


好像没有,只有非常简单的使用介绍。英文版是有的。
symmacros
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原文由 thxdyx(thxdyx) 发表:
我想请问一下,AMDIS相较于普通的谱库检索有什么样的优越性吗?


经过AMDIS处理后,让目标化合物从基质和干扰物分离出来。这样干净而纯的质谱图非常有利于PBM质谱谱库检索或其它谱图检索解析工具。这样对共流出的度组分,大峰中小成分,基质掩盖的痕量组分分析度很有利。
lixinning
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原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
这种情况还没有遇到过。把您的数据文件发给我,我来试试。站内短信里有我Email。

麻烦问一下您,那个数据文件您打开了没
不好意思,网速太慢,点了好几次,后来才看见发了三次。
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2010/4/2 10:55:39 Last edit by lixinning
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这种情况还没有遇到过。把您的数据文件发给我,我来试试。站内短信里有我Email。

麻烦问一下您,那个数据文件您打开了没
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这种情况还没有遇到过。把您的数据文件发给我,我来试试。站内短信里有我Email。

麻烦问一下您,那个数据文件您打开了没


抱歉,忘记了,没有及时给您回信。岛津的数据还不知道如何打开。 AIA(cdf)打开的情况和您的一样, 有一条斜线,我想这是因为您可能在大概4.34-4.5分钟及19.78分钟以后没有采集数据或关闭MS检测器,这样有一段没有基线而造成在Amdis打开的TIC有一条斜线的原因。在Amdis上可能需要连续的采样数据。不过您的数据仍可以正常用Amdis进行解卷积处理。我用自己的cdf格式的文件打开的TIC和工作站上打开的一样(连续采集数据)。
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2010/4/2 13:05:15 Last edit by jimzhu
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这种情况还没有遇到过。把您的数据文件发给我,我来试试。站内短信里有我Email。

麻烦问一下您,那个数据文件您打开了没


抱歉,忘记了,没有及时给您回信。岛津的数据还不知道如何打开。 AIA(cdf)打开的情况和您的一样, 有一条斜线,我想这是因为您可能在大概4.34-4.5分钟及19.78分钟以后没有采集数据或关闭MS检测器,这样有一段没有基线而造成在Amdis打开的TIC有一条斜线的原因。在Amdis上可能需要连续的采样数据。不过您的数据仍可以正常用Amdis进行解卷积处理。我用自己的cdf格式的文件打开的TIC和工作站上打开的一样。

lixinning
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这种情况还没有遇到过。把您的数据文件发给我,我来试试。站内短信里有我Email。

麻烦问一下您,那个数据文件您打开了没


抱歉,忘记了,没有及时给您回信。岛津的数据还不知道如何打开。 AIA(cdf)打开的情况和您的一样, 有一条斜线,我想这是因为您可能在大概4.34-4.5分钟及19.78分钟以后没有采集数据或关闭MS检测器,这样有一段没有基线而造成在Amdis打开的TIC有一条斜线的原因。在Amdis上可能需要连续的采样数据。不过您的数据仍可以正常用Amdis进行解卷积处理。我用自己的cdf格式的文件打开的TIC和工作站上打开的一样(连续采集数据)。

谢谢您了。数据是连续采集的,前面4.5分钟是切掉了,后面19.78分钟出的峰很少。不过在amdis中拖拉一下,4.5-19min会出来一点,但不好掌握,所以总离子流图不好出来。
lixinning
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原文由 thxdyx(thxdyx) 发表:
我想请问一下,AMDIS相较于普通的谱库检索有什么样的优越性吗?


经过AMDIS处理后,让目标化合物从基质和干扰物分离出来。这样干净而纯的质谱图非常有利于PBM质谱谱库检索或其它谱图检索解析工具。这样对共流出的度组分,大峰中小成分,基质掩盖的痕量组分分析度很有利。

      对于AMDIS来说,如果是单个峰,它提取出来的应该该和工作站检索出来的物质是一样吧?amdis检索出来的结果如何和工作站做对比那?amdis检索出来的结果就是工作站检索不出来的吗?(就是tic右边的结果窗口检索出来的就是解卷积出来的物质结果吗,也就是说工作站比如岛津的检索不到的吗)目标离子轮廓图表示什么意思那?
      还有,我看您第二讲有C6-C26-mix.d数据文件,麻烦您能给我发一份吗,我没有数据文件练习不了。
问题有点多,谢谢您了。
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2010/4/23 15:23:05 Last edit by lixinning
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我想请问一下,AMDIS相较于普通的谱库检索有什么样的优越性吗?


经过AMDIS处理后,让目标化合物从基质和干扰物分离出来。这样干净而纯的质谱图非常有利于PBM质谱谱库检索或其它谱图检索解析工具。这样对共流出的度组分,大峰中小成分,基质掩盖的痕量组分分析度很有利。

      对于AMDIS来说,如果是单个峰,它提取出来的应该该和工作站检索出来的物质是一样吧?amdis检索出来的结果如何和工作站做对比那?amdis检索出来的结果就是工作站检索不出来的吗?(就是tic右边的结果窗口检索出来的就是解卷积出来的物质结果吗,也就是说工作站比如岛津的检索不到的吗)目标离子轮廓图表示什么意思那?
      还有,我看您第二讲有C6-C26-mix.d数据文件,麻烦您能给我发一份吗,我没有数据文件练习不了。
问题有点多,谢谢您了。


如果是单个峰,它提取出来的应该该和工作站检索出来的物质是一样,这时Amdis就可能失去优势。amdis对共流出组分,大峰干扰的组分和本底干扰时候处理,就会得到更多的信息。目标离子轮廓图就是在Amdis库中所选择的三个目标离子的质谱图。
cjf06301
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