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主题：【讨论】关于Amdis的两个问题

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symmacros
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发表于：2011/04/20 21:39:04 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
有网友问我两个有关Amdis的问题：

1、在AMDIS的菜单栏“Analyze”下的“analysis setting”中的“identif.”选项卡中的“only reverse search”一般是不是打钩选上对分析比较好？

2、在“analysis setting”中的“deconv.”选项卡中的“omit m/z”是否要勾选，如果勾选，是不是填入柱流失的特征离子，如149、207、355等？
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2011/4/20 22:07:38 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
1. 缺省值是不打√。建议一般不打√，如果开启，有可能和minimum match factor会冲突。如果打√，则amdis将使用反向检索值作为标准来决定是否选择保留这个目标识别结果。
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symmacros
jimzhu
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2011/4/20 22:22:45 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
2 缺省值也是不打√。也是建议一般不打√。如果选择某一离子，则这个离子将在去卷积化时会忽略此离子来绘色谱图。一般对于柱流失的特征离子，amdis会自动以解卷积方式处理。

以上是我的简单理解，望版友指正或更详细的解释。
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xiaomai0070
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2011/4/21 8:51:59 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
谢谢热心的zhu老师！也希望更多的朋友来帮我指点迷津……
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yuduoling
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2011/4/21 9:16:00 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
一般都不勾选的
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lucia_J
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2011/4/21 9:30:15 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
既然版主在讲AMDIS 的问题，我顺便问一句：我的工作站和谱库重新安装以后，怎么调用数据，点击RUN，AMDIS不帮我分析，直接提示错误，这是为什么呢？
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symmacros
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2011/4/21 10:05:55 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 lucia_J(hgy154) 发表:
既然版主在讲AMDIS 的问题，我顺便问一句：我的工作站和谱库重新安装以后，怎么调用数据，点击RUN，AMDIS不帮我分析，直接提示错误，这是为什么呢？


请问提示什么错误信息？

如果是重新安装工作站和谱库，原来的Amdis的路径可能改变。但如果是从NIST软件安装应该不会改变。请问是从工作站进入Amdis还是从程序启动进入Amdis？
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learner1999
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2011/4/21 11:17:49 7楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
1. 缺省值是不打√。建议一般不打√，如果开启，有可能和minimum match factor会冲突。如果打√，则amdis将使用反向检索值作为标准来决定是否选择保留这个目标识别结果。

reverse match的数值考虑单一片面
minimum match factor 所计算的数值是net
可以这么认为吧？
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learner1999
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2011/4/21 11:26:23 8楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
2 缺省值也是不打√。也是建议一般不打√。如果选择某一离子，则这个离子将在去卷积化时会忽略此离子来绘色谱图。一般对于柱流失的特征离子，amdis会自动以解卷积方式处理。

以上是我的简单理解，望版友指正或更详细的解释。

那这个功能什么情况使用呢？
他能不能针对某一个色谱峰进行忽略选中的离子呢？而不是整个谱图
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symmacros
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2011/4/21 12:40:47 9楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 learner1999(learner1999) 发表:
原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
1. 缺省值是不打√。建议一般不打√，如果开启，有可能和minimum match factor会冲突。如果打√，则amdis将使用反向检索值作为标准来决定是否选择保留这个目标识别结果。

reverse match的数值考虑单一片面
minimum match factor 所计算的数值是net
可以这么认为吧？


是的，打钩是仅仅考虑reverse检索和匹配度，对正向检索匹配度（minimum match factor或net)不预考虑。所以通常不选为好，但有的时候干扰较大的情况，仅考虑reverse结果也许会好点。
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symmacros
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2011/4/21 13:04:32 10楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 learner1999(learner1999) 发表:
原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
2 缺省值也是不打√。也是建议一般不打√。如果选择某一离子，则这个离子将在去卷积化时会忽略此离子来绘色谱图。一般对于柱流失的特征离子，amdis会自动以解卷积方式处理。

以上是我的简单理解，望版友指正或更详细的解释。

那这个功能什么情况使用呢？
他能不能针对某一个色谱峰进行忽略选中的离子呢？而不是整个谱图


这个功能可能在某些在整个TIC干扰较明显的离子的过滤有用，在解卷积时或提取离子的色谱图中忽略掉。

是针对整个谱图，不针对某一个色谱峰进行忽略选中的离子。如果想要针对某一个色谱峰进行忽略选中的离子，可能要在amdis的谱库（MSL）里的离子选择上改动而实现。

这是我粗浅的看法，看看网友还有什么高见和指正？
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