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主题：【讨论】NIST中分子量检索和MS解析碎片分析

浏览0 回复8 电梯直达
symmacros
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发表于：2011/05/02 13:10:11 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
有网友问我“您好，我看了你nist库检索笔记，可是我还是不知道怎么根据分子量检索可能的分子碎片图？我在tool下选ms interpreter，进去后我并不知道我这个物质的分子量，因为是未知的，我只看到上面有的碎片离子，如151,153，我怎么利用nist库或者什么途径知道哪些碎片离子的质量数是151,153呢？等等，期待老师的详解，谢谢”

也请大家帮助解答，谢谢。
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symmacros
jimzhu
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2011/5/2 13:25:26 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
根据分子量检索可能的分子碎片图

在NIST Search主界面的Search菜单下面选Molecular Weight，点击后进入Molecular Weight Search界面，在Enter Molecular Weig里输入要检查的分子量，按search，就会得到这个分子量的化合物的图谱（碎片）。

如果仅仅输入分子量，没有选constraint（约束或限定），哪就会把您所选的谱库里的所有这个分子量的化合物检索并列出了。

您可以利用constraint，在NameFragment，Elemrents Vaue,Elements Pesent, Peaks及Other Database输入相应的值来限定检索范围，以减少检索范围。
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2011/5/2 13:33:00 Last edit by jimzhu
symmacros
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2011/5/2 13:32:33 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
从离子碎片来检索

在NIST Search主界面的Search菜单下面选Peaks，点击后进入Any Peaks Search界面，在Peaks里输入要检索的离子，例如151,153，按search，就会得到这写离子碎片的化合物的图谱。同样利用constraint，来限定检索范围，以减少检索范围。
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yuduoling
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2011/5/2 21:28:26 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
多谢楼主介绍的这么详细
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疯子
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2011/5/3 8:52:19 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
谢谢楼主解释，我今天试了，还是很头大，constraint里的条件好像都不好用。。估计还要摸索。
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symmacros
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2011/5/3 9:53:11 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 疯子(3866625) 发表:
谢谢楼主解释，我今天试了，还是很头大，constraint里的条件好像都不好用。。估计还要摸索。


多熟悉，就会好的，可以先从单个限定参数试试，然后是多个参数。有时候单个参数就可以很好过滤不必要的化合物了。
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疯子
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2011/5/3 11:09:14 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
原文由 疯子(3866625) 发表:
谢谢楼主解释，我今天试了，还是很头大，constraint里的条件好像都不好用。。估计还要摸索。


多熟悉，就会好的，可以先从单个限定参数试试，然后是多个参数。有时候单个参数就可以很好过滤不必要的化合物了。

恩，谢谢您，选定一个分子量时，后面的比例怎么设置比较好呢？如果是基峰我是不是该设置成95%-100%啊？如果不是基峰呢？是根据与基峰的比例吗？
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symmacros
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2011/5/3 12:26:03 7楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 疯子(3866625) 发表:
原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
原文由 疯子(3866625) 发表:
谢谢楼主解释，我今天试了，还是很头大，constraint里的条件好像都不好用。。估计还要摸索。


多熟悉，就会好的，可以先从单个限定参数试试，然后是多个参数。有时候单个参数就可以很好过滤不必要的化合物了。

恩，谢谢您，选定一个分子量时，后面的比例怎么设置比较好呢？如果是基峰我是不是该设置成95%-100%啊？如果不是基峰呢？是根据与基峰的比例吗？


如果是基峰我可以设置范围宽一点例如80-100%，可以避免有时候标准图谱和测定的条件差异引起的丰度比例不一致而不能检索到的问题。如果不是基峰，是根据与基峰的比例，合适放宽一点。
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gaogao0214
hygao8410
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2011/5/3 16:13:59 8楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
很受用，学习了
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