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X射线衍射仪（XRD）

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仪器社区 > X射线仪器 > X射线衍射仪（XRD）帖子详情

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主题：【求助】关于同一个空间群，选择不同的坐标原点，Wyckoff位置如何转变！

浏览0 回复11 电梯直达

wgjszx

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发表于：2011/08/16 20:43:05 楼主管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

悬赏金额：20积分状态：已解决

空间群227（Fd-3m）的坐标原点有两种选择，8a（-43m）或者16c（-3m）。
不论哪种坐标原点，8a，8b，16c，16d的Wyckoff位置是明确的。
问题是：
原点在8a（-43m）和16c（-3m）的32e位置为（x，x，x）。但两个位置值肯定是不同的。

如原点在8a时，32e位置为（0.808，0.808，0.808）。那么原点取在16c时，32e处的值为多少？
为什么？
直接减去0.125（1/8）好像是不对。因为输入到软件中，得到的结果不同，且有原子和相邻原子
没有键连接，呈悬空状态！

谢谢！急！！！

推荐答案：蓝莓口香糖回复于2011/08/19

我一直用这个，还不错。
http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20090126/1712695/

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2011/8/16 21:16:01 沙发管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

这个真不会~~哪位晶体学达人来讲解下.........

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dahua1981

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2011/8/17 8:48:37 板凳管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

晶体解析直接不会啊

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金水楼台先得月

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ID：albert800922

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2011/8/17 17:04:43 马扎管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

这类问题以前是怎么处理的呢

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wgjszx

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2011/8/17 21:00:54 地毯管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

晶体数据库一半给出第一个原点的数据（origin choice 1），而一些软件需要输入的是第二个原点的数据（origin choice2）。简单的自己进行了转换，这个太复杂，有点晕。
谢谢回复！
继续等待高手！！！

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洪星二锅头

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2011/8/18 8:46:56 地板管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

原文由 wgjszx(wgjszx) 发表:
空间群227（Fd-3m）的坐标原点有两种选择，8a（-43m）或者16c（-3m）。
不论哪种坐标原点，8a，8b，16c，16d的Wyckoff位置是明确的。
问题是：
原点在8a（-43m）和16c（-3m）的32e位置为（x，x，x）。但两个位置值肯定是不同的。

如原点在8a时，32e位置为（0.808，0.808，0.808）。那么原点取在16c时，32e处的值为多少？
为什么？
直接减去0.125（1/8）好像是不对。因为输入到软件中，得到的结果不同，且有原子和相邻原子
没有键连接，呈悬空状态！

谢谢！急！！！

我觉得你选的原点有问题，选择的原点应该具备最高的对称性，其中的8a、8b的对称性都为-43m，可以通过原点直接得出空间群所有的等效点

而当选择16c时，对称性仅仅为-3m，通过操作无法获得Fd-3m所有的等效点，所以就不存在你所32e位置的变动

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2011/8/18 9:48:24 Last edit by coime

大陆

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2011/8/18 18:54:04 6楼管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

原点在8a时，32e位置为（0.808，0.808，0.808），这个不妥，应该变换到最简单元空间里(Asymmetric unit)，即x值应当在0-0.5之间。所以，你不妨试试：（0.192，0.192，0.192）。

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蓝莓口香糖

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2011/8/18 19:30:07 7楼管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

没觉得有什么不一样。

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wgjszx

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2011/8/19 0:29:30 8楼管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

原文由 coime(coime) 发表:
原文由 wgjszx(wgjszx) 发表:
空间群227（Fd-3m）的坐标原点有两种选择，8a（-43m）或者16c（-3m）。
不论哪种坐标原点，8a，8b，16c，16d的Wyckoff位置是明确的。
问题是：
原点在8a（-43m）和16c（-3m）的32e位置为（x，x，x）。但两个位置值肯定是不同的。

如原点在8a时，32e位置为（0.808，0.808，0.808）。那么原点取在16c时，32e处的值为多少？
为什么？
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我觉得你选的原点有问题，选择的原点应该具备最高的对称性，其中的8a、8b的对称性都为-43m，可以通过原点直接得出空间群所有的等效点

而当选择16c时，对称性仅仅为-3m，通过操作无法获得Fd-3m所有的等效点，所以就不存在你所32e位置的变动

请参阅网址：http://www.cryst.ehu.es/cgi-bin/cryst/programs/nph-wp-list
227就是有两个原点选择。一个高对称，一个此对称。
Find It中给出的是origin choice 1的，而有的软件就是要输入origin choice 2的。这是问题所在。
谢谢你的回复！

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