主题:【讨论】液相色谱测小分子量肽的柱子选择

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junqingzhou11
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我准备用高效液相色谱测酶水解蛋白的肽的分子量(小于1万道尔顿),应该用凝胶柱吧,不知哪种型号的好些呢?
洗脱液用什么呢?可以用蒸馏水么?
另外如果是液相的半制备,制备量大概是多少呢?
推荐答案:tianru的爸爸回复于2006/12/11

如果说要测分子量,可以用凝胶柱。
但如果要测小分子量,那两个(TSK 2000 SW/PW)都测不了5000以下的,至少测不准。
建议用质谱测定分子量,理由就不用说了吧。
补充答案:

shaoylc回复于2006/12/10

一般来说肽段用的是乙腈,水,磷酸或磷酸盐类的缓冲溶剂这些东西的混合体系。很多情况下PH值可能到2左右。所以柱子的选择还要考虑这些因素。我用C18柱做过,不过分子量只是一两千左右,没有到八九千。这个分子量范围反相柱不知道容不容易堵,柱压怎么样。你再看看文献。

Easy-Boy回复于2006/12/08

用毛细管电泳做更好吧?

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谢谢你的关注!
但是我的问题您还是没能让我满意,现在很多人用液相测,很实在的,因为存在要分离制备而不仅仅是分析。
tianru的爸爸
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原文由 junqingzhou11 发表:
我准备用高效液相色谱测酶水解蛋白的肽的分子量(小于1万道尔顿),应该用凝胶柱吧,不知哪种型号的好些呢?

具体是用凝胶柱还是用反相柱,要看你的目的是什么。
如果只是想把酶水解的产物有所分离,什么都可以。
如果想把每一个产物得到具体的分离(甚至鉴定序列,那要用反相)。
如果只是想看看酶水解的程度,可以用凝胶,这个相对简单,好分析。
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原文由 junqingzhou11 发表:
洗脱液用什么呢?可以用蒸馏水么?

洗脱液用什么,要看具体的蛋白/多肽,因为各种蛋白多肽的极性、溶解性不一样。
至于蒸馏水,一般不用,无论是凝胶柱,还是反相柱,都尽量避免用纯水来洗脱。
junqingzhou11
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我准备用凝胶柱测水解物的分子量范围,然后根据不同的范围收集肽,然后再在以后的分析中用。那时候可能要分纯,测序等等。
tianru的爸爸
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原文由 junqingzhou11 发表:
我准备用高效液相色谱测酶水解蛋白的肽的分子量(小于1万道尔顿),应该用凝胶柱吧,不知哪种型号的好些呢?
洗脱液用什么呢?可以用蒸馏水么?
另外如果是液相的半制备,制备量大概是多少呢?

半制备和制备的量一般没有明确的数,少量的制备一般就被称为半制备,如果制备的量比较大(具体有多大,可以是g级,也可以是mg级,甚至是Kg级才被成为制备,而非半制备),就称为制备。
有一个是肯定,无论是半制备液相,还是制备液相,其液相色谱分离后的产物是我们想要得到的产物。

如果想用酶水解蛋白,然后再用液相分离水解产物,最后用MS等手段解析水解产物,那这时的制备量可以到ng级就够用了,也就是酶水解蛋白时,蛋白的量有10到20微克就可以了。
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Last edit by lxdongzi2003
junqingzhou11
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您讲的比较详细,十分感谢,制备这方面稍懂了,
蒙哥麻利
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学习了,希望楼主做完了上传些总结性的东东,
支持中
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shaoylc
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一般来说肽段用的是乙腈,水,磷酸或磷酸盐类的缓冲溶剂这些东西的混合体系。很多情况下PH值可能到2左右。所以柱子的选择还要考虑这些因素。我用C18柱做过,不过分子量只是一两千左右,没有到八九千。这个分子量范围反相柱不知道容不容易堵,柱压怎么样。你再看看文献。
junqingzhou11
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我准备买根凝胶柱测分子量低于一万道尔顿的小肽混合物,这根柱子一万多,所以现在考虑买哪种型号的。
查资料有TSK gel 2000 SWxl
        TSK gel 2000 PW系列的,
根据商家提供资料,测分子量5000以上,他们又说可以测5000以下的,我现在在慎重考虑,不知谁已做过这方面的试验,请交流一下经验。
谢谢!
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