主题:【讨论】液质联用QTOF推测代谢产物什麽软件效率高,易用?

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iamyangdoctor
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如题。后期解析效率高。
survey scan是什麽?全扫描?应该是一级质谱扫描。
DDA: Mode of data collection in tandem mass spectrometry in which a fixed number of precursor ions whose m/z values were recorded in a survey scan are selected using predetermined rules and are subjected to a second stage of mass selection in an MS/MS analysis.
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hujiangtao
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weiqing
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要看是哪家的仪器了,不同厂商数据处理软件都不一样。
iamyangdoctor
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原文由 weiqing(weiqing1983) 发表:
要看是哪家的仪器了,不同厂商数据处理软件都不一样。
都大同小异吗,还是某家会有独到的优势?
iamyangdoctor
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在药物发展阶段,强大的功能如实时多重质量亏损(MMDF)触发
IDA和高质量准确度的MS/MS能在表征体内代谢物的同时进行深入
的结构阐明。
如果有人看过AB SCIEX TripleTOF5600+的宣传资料,就会发现这台质谱有一个非常特殊的工作模式叫:SWATH(sequential window acquisition of alltheoretical spectra)。这实际上是一种DIA(data-independent ·acquisition)采集策略。
这两段一个IDA,一个DIA,是两个概念,还是一个?
iamyangdoctor
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原文由 iamyangdoctor(iamyangdoctor) 发表:
在药物发展阶段,强大的功能如实时多重质量亏损(MMDF)触发
IDA和高质量准确度的MS/MS能在表征体内代谢物的同时进行深入
的结构阐明。
如果有人看过AB SCIEX TripleTOF5600+的宣传资料,就会发现这台质谱有一个非常特殊的工作模式叫:SWATH(sequential window acquisition of alltheoretical spectra)。这实际上是一种DIA(data-independent ·acquisition)采集策略。
这两段一个IDA,一个DIA,是两个概念,还是一个?

Spectronaut™软件支持QExactive™质谱IDA采集模式

新型Spectronaut™软件支持赛默飞Q Exactive™质谱采集的DIA数据


weiqing
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相对而言AB的灵敏度更高,液相要配好一点比如Waters的UPLC。他家也有专门的多数据处理系统要另外买,需要列在合同里。
huanyu7504
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原文由 iamyangdoctor(iamyangdoctor) 发表:在药物发展阶段,强大的功能如实时多重质量亏损(MMDF)触发IDA和高质量准确度的MS/MS能在表征体内代谢物的同时进行深入的结构阐明。如果有人看过AB SCIEX TripleTOF5600+的宣传资料,就会发现这台质谱有一个非常特殊的工作模式叫:SWATH(sequential window acquisition of alltheoretical spectra)。这实际上是一种DIA(data-independent ·acquisition)采集策略。这两段一个IDA,一个DIA,是两个概念,还是一个?
俩概念,IDA是数据依赖性采集(就是以 一级TOF的数据为依据,判断是否采集 二级谱图)。DIA是非数据依赖性的采集,把关注的离子质量区域分段,全部采集二级谱图。
iamyangdoctor
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原文由 iamyangdoctor(iamyangdoctor) 发表:

Spectronaut™软件支持QExactive™质谱IDA采集模式

新型Spectronaut™软件支持赛默飞Q Exactive™质谱采集的DIA数据


IDA是Information-dependent acquisition,信息依赖扫描,最常见数据采集方法。 跟DIA(data independent acquisition)两回事。
iamyangdoctor
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原文由 weiqing(weiqing1983) 发表:
相对而言AB的灵敏度更高,液相要配好一点比如Waters的UPLC。他家也有专门的多数据处理系统要另外买,需要列在合同里。


平台有bruker的QTOF,我关心的两种采集模式auto MS/MS,Broadband CID (bbCID) Data Acquisition。用于创新药物的口服后代谢物的鉴定,哪种采集模式好呢?


这两个模式应该一个是IDA(或DDA),另一个是DIA。


DIA时,如果某时刻共流出物质种类多,一打二级,结果会乱七八糟,难以解析吗?
weiqing
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