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主题：【讨论】液质联用QTOF推测代谢产物什麽软件效率高，易用？

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iamyangdoctor
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发表于：2018/12/04 22:29:44 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
如题。后期解析效率高。
survey scan是什麽？全扫描？应该是一级质谱扫描。
DDA: Mode of data collection in tandem mass spectrometry in which a fixed number of precursor ions whose m/z values were recorded in a survey scan are selected using predetermined rules and are subjected to a second stage of mass selection in an MS/MS analysis.
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2018/12/5 10:07:26 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
每家都有自己的解谱软件，好像不能通用吧
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2018/12/5 11:15:29 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
要看是哪家的仪器了，不同厂商数据处理软件都不一样。
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2018/12/5 13:50:55 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 weiqing(weiqing1983) 发表:
要看是哪家的仪器了，不同厂商数据处理软件都不一样。
都大同小异吗，还是某家会有独到的优势？
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2018/12/5 13:54:25 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
在药物发展阶段，强大的功能如实时多重质量亏损（MMDF）触发
IDA和高质量准确度的MS/MS能在表征体内代谢物的同时进行深入
的结构阐明。
如果有人看过AB SCIEX TripleTOF5600+的宣传资料，就会发现这台质谱有一个非常特殊的工作模式叫：SWATH（sequential window acquisition of alltheoretical spectra）。这实际上是一种DIA（data-independent ·acquisition）采集策略。
这两段一个IDA，一个DIA，是两个概念，还是一个？
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2018/12/5 14:29:02 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 iamyangdoctor(iamyangdoctor) 发表:
在药物发展阶段，强大的功能如实时多重质量亏损（MMDF）触发
IDA和高质量准确度的MS/MS能在表征体内代谢物的同时进行深入
的结构阐明。
如果有人看过AB SCIEX TripleTOF5600+的宣传资料，就会发现这台质谱有一个非常特殊的工作模式叫：SWATH（sequential window acquisition of alltheoretical spectra）。这实际上是一种DIA（data-independent ·acquisition）采集策略。
这两段一个IDA，一个DIA，是两个概念，还是一个？

Spectronaut™软件支持QExactive™质谱IDA采集模式

新型Spectronaut™软件支持赛默飞Q Exactive™质谱采集的DIA数据


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weiqing
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2018/12/5 16:37:26 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
相对而言AB的灵敏度更高，液相要配好一点比如Waters的UPLC。他家也有专门的多数据处理系统要另外买，需要列在合同里。
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huanyu7504
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2018/12/6 0:51:04 7楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 iamyangdoctor(iamyangdoctor) 发表:在药物发展阶段，强大的功能如实时多重质量亏损（MMDF）触发IDA和高质量准确度的MS/MS能在表征体内代谢物的同时进行深入的结构阐明。如果有人看过AB SCIEX TripleTOF5600+的宣传资料，就会发现这台质谱有一个非常特殊的工作模式叫：SWATH（sequential window acquisition of alltheoretical spectra）。这实际上是一种DIA（data-independent ·acquisition）采集策略。这两段一个IDA，一个DIA，是两个概念，还是一个？
俩概念，IDA是数据依赖性采集（就是以 一级TOF的数据为依据，判断是否采集 二级谱图）。DIA是非数据依赖性的采集，把关注的离子质量区域分段，全部采集二级谱图。
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2018/12/6 7:36:00 8楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 iamyangdoctor(iamyangdoctor) 发表:

Spectronaut™软件支持QExactive™质谱IDA采集模式

新型Spectronaut™软件支持赛默飞Q Exactive™质谱采集的DIA数据


IDA是Information-dependent acquisition，信息依赖扫描，最常见数据采集方法。 跟DIA（data independent acquisition）两回事。
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iamyangdoctor
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2018/12/6 7:55:40 9楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 weiqing(weiqing1983) 发表:
相对而言AB的灵敏度更高，液相要配好一点比如Waters的UPLC。他家也有专门的多数据处理系统要另外买，需要列在合同里。


平台有bruker的QTOF，我关心的两种采集模式auto MS/MS，Broadband CID (bbCID) Data Acquisition。用于创新药物的口服后代谢物的鉴定，哪种采集模式好呢？


这两个模式应该一个是IDA（或DDA），另一个是DIA。


DIA时，如果某时刻共流出物质种类多，一打二级，结果会乱七八糟，难以解析吗？
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2018/12/6 8:31:15 10楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
可以咨询一下仪器应用工程师先了解下。
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