敲低ODC1前后的分析结果图

敲低ODC1前后差异蛋白火山图与热图分析

对归一化的原始数据进行样本间分析，结果显示两组样本分组可靠。对归一化数据用FC值以及 T 检验统计学方法进行样本差异表达蛋白的筛选，筛选标准如下：差异倍数大于1.5倍或小于0.67倍，P ＜0.05。共筛选出符合筛选条件的差异蛋白280个，其中上调的有170个，下调的蛋白有110个。筛选结果用火山图和差异蛋白层级聚类热图进行直观展示。

敲低ODC1前后差异蛋白GO与KEGG的富集分析

对蛋白质组学结果进行生物信息学分析得出，敲低ODC1前后上调蛋白分子功能显示主要参与泛素偶联酶的活性、mRNA结合、核定位序列结合、p53结合、肽抗原结合、MHCII类受体活性等。细胞组分分析显示主要参与MHC蛋白复合物、MHCII类蛋白复合物、细胞内部分等。生物过程分析显示主要有丝分裂姐妹染色单体分离、抗原通过……进行外源性肽抗原的加工和呈递、有丝分裂细胞周期等。

通过蛋白质组学分析得出，敲低ODC1前后下调蛋白分子功能显示主要参与肿瘤坏死因子受体超家族结合、泛素样蛋白连接酶的结合、泛素蛋白连接酶结合等。细胞组分分析显示主要参与细胞外囊泡、细胞外外泌体等。生物过程分析显示主要有机物的分解代谢过程、大分子定位、调节胞吐作用、胞外分泌、细胞分解代谢过程、囊泡介导的运输等。

通过KEGG分析，敲低ODC1前后差异蛋白主要富集的前15个通路：FcγR介导的吞噬作用、丙酸代谢、真核生物核糖体生物发生、核质转运、β-丙氨酸代谢、泛素介导的蛋白质水解、脂肪酸降解、胰岛素抵抗、B细胞受体信号通路、RNA降解、卟啉代谢等。

敲低ODC1前后差异蛋白互作网络图

通过 STRING 数据库，根据蛋白质与蛋白质之间直接的物理互作和间接的功能关联，结合差异表达基因分析结果和数据库收录的互作关系对，构建了与ODC1蛋白互作的蛋白网络图以及差异表达基因蛋白互作网络图。

小结

通过蛋白质组学分析，共筛选出具有统计学意义的差异蛋白280个，其中上调的有170个，下调的蛋白有110个；敲低ODC1前后上调蛋白的分子功能显示主要参与泛素偶联酶的活性、mRNA结合等。细胞组分分析显示主要为细胞质部分、MHC蛋白复合物等。生物过程分析显示主要参与有丝分裂姐妹染色单体分离、蜂窝组件组织；通过蛋白质组学分析得出，敲低ODC1前后下调蛋白分子功能显示主要参与乙醛脱氢酶（NAD）活性等。细胞组分分析显示主要为细胞内部分等。生物过程分析显示主要参与有机物的分解代谢过程等。通过KEGG分析，敲低ODC1前后差异蛋白主要富集的通路：B细胞受体通路、泛素偶联酶活化通路、MHC蛋白复合物形成通路，FcγR介导的吞噬作用等，我们后续将从EP300、DLG1、CDK14等蛋白分子及B细胞受体通路、MHC蛋白复合物形成通路，FcγR介导的吞噬等通路进行进一步研究。

附件：

2-8 敲低ODC1前后的分析结果图.docx(未验证)