主题:【第十七届原创】SCIEX QTRAP 5500 Glu-Fibrinopeptide B 调源标准操作规程

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zhangyongmei
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1.目的

保证在QTRAP5500 nano源下,用注射器进行正确的调源

2.责任

设备负责人应根据维护计划定期对QTRAP5500进行离子阱质量校正;

所有操作人员必须严格按照本操作规程所规定操作;

3.实验原理

特征峰的强度表征仪器的灵敏度。




4.操作步骤




4.1 Q1(推荐的调源方式)

4.1.1进入Analyst软件界面,双击Manual Tuning

4.1.2打开调源的文件,进Glu-Fibrinopeptide B的终溶液(浓度50fmol/μl),选择 ,勾上use(),设置,选择流速为300nl/min(500nl/min);

4.1.3改变喷针的位置优化信号强度,注意喷雾不要太靠近orifice,改变heated interface的温度,优化信号和降低背景噪音,另外,可以调整CUR、IS和GS1;

4.1.4一旦出现了稳定的喷雾,进行Q1扫描5分钟,同时观测喷雾的稳定性,良好的状态是:在TIC窗口中起伏很小,并且噪音峰也是很低、很短暂的;

4.1.5接着,用MCA方式采集10个Cycles,保存数据:Sample Name: Q1 scan ,Data File: QTRAP system Nanospray Test <DATE>;

4.1.6打开数据文件,放大m/z为786的峰(View -> Graph Info Window), 看intensity是否达到3e6;达到后则记下喷雾与源气参数,此时的灵敏度为最优。

4.2 EMS(紧接Q1)

4.2.1打开调源的文件,切换到EMS扫描模式,按表1,设置一些参数,其它值先按经验值设置;

4.2.2调整源气参数或源的位置,按表2看主要的特征峰是否出现,一旦喷雾稳定,保存数据:Sample Name: EMS scan ,Data File: QTRAP system Nanospray Test <DATE>;

1


Tab

Parameter

Setting



MS
Scan typeEnhanced MS(EMS)
PolarityPositive
MCASelect checkbox
Start(amu)/Stop(amu)400.000/1000.000
Optimize MassesClick button
Number of scans to sum1
Cycles10


Advanced MS
Scan rate(Da/s)10,000
Fixed LIT fill time(ms)0.5ms
Q0 TrappingDeselect checkbox

2


M+nH)n+ monoisotopic m/z for charge of Glu-Fibrinopeptide B

+1+2+3+4+5+6
1570.6768785.8421524.2305393.4247


4.2.3 m/z为786的峰,intensity需达到3e6。

4.3 EPI

4.3.1 打开调源的文件,按表3,设置一些参数,其它值先按经验值设置;







3


Tab

Parameter

Setting

ResolutionQ1 ResolutionUnit
MSScan typeEPI
PolarityPositive
Product Of(amu)785.9
MCASelect checkbox
Start(amu)/Stop(amu)100.000/280.000

275.000/1000.000
Optimize MassesClick button
Number of scans to sum1
Cycles10
Advanced MSScan rate(Da/s)20,000
Fixed LIT fill time(ms)10
Q0 TrappingOff


4.3.2按表4看主要的特征峰是否出现;

4 Theoretical fragment ions of Glu-Fibrinopeptide B


b ions

y ions

(m/z)

Fragment

(m/z)

Fragment

1570.6768

EGVNDNEEGFFSAR

130.0499

E

1441.6342

GVNDNEEGFFSAR

187.0713

EG

1384.6128

VNDNEEGFFSAR

286.1397

EGV

1285.5444

NDNEEGFFSAR

400.1827

EGVN

1171.5014

DNEEGFFSAR

515.2096

EGVND

1056.4745

NEEGFFSAR

629.2525

EGVNDN

942.4316

EEGFFSAR

758.2951

EGVNDNE

813.3890

EGFFSAR

887.3377

EGVNDNEE

684.3464

GFFSAR

944.3592

EGVNDNEEG

627.3249

FFSAR

1091.4276

EGVNDNEEGF

480.2565

FSAR

1238.4960

EGVNDNEEGFF

333.1881

SAR

1325.5281

EGVNDNEEGFFS

246.1561

AR

1396.5652

EGVNDNEEGFFSA

175.1190

R

1552.6663

EGVNDNEEGFFSAR



4.3.3按表5看主要的特征峰(不需要全部的峰都出现)的Intensity是否接近或达到说明书的示范图的指标;

5


m/z

246.156

333.188

480.257

627.325

684.346

813.389

942.432

Intensity

7e5

4.1e6

4.0e6

1.5e6

7.0e6

4.0e6

2.5e6



4.3.4调源完成后,保存数据,不保存方法。

5.质量标准与评估

质量指标名称

质量指标

测量方法

m/z为786的intensity≥3e6Q1 scan
m/z为785.8的intensity≥3e6EMS scan




6.参考文献


AB SCIEX QTRAP 5500 System Installation Guide

7.注意事项

7.1
如果特征峰的intensity太低,用Q1扫描模式调整nano源的条件保证达到最佳的位置、针尖突出长度以及源气参数;

7.2如果S/N太低,调整源的条件保证达到最佳的位置、针尖突出长度以及源气参数,若注射器注射过其他样品,应在实验前用新的样品清洗一下注射器。

7.3调源时须注意带乳胶手套,以免高压触电;

7.4仪器正常运行时,禁止接触离子源和打开离子源盖,避免受到高温、高压和激光伤害;

7.5仪器停止工作后半小时内,禁止接触离子源,避免受到高温的伤害;

8.附录

附录A:实验仪器设备

附录B:实验试剂和耗材

C:试剂配制方法

附录D:修订记录

附录A实验仪器设备

仪器名称

型号

厂家

QTRAP5500QTRAP5500AB SCIEX




附录B实验试剂和耗材

试剂


试剂名称

型号

厂家

乙腈HPLC 4LFisher Chemical
纯水 millpore
甲酸HPLC 50ml迪马
Glu-Fibrinopeptide B100μgAB SCIEX


耗材



耗材名称

型号

厂家

离心管1.5ml爱思进
枪头10μl、200μl、1000μl爱思进
注射器一体100μl,内径1.46mm迪马








附录C 试剂配制方法

1.1储液
100μg Glu-Fibrinopeptide B的瓶内加入600μl×2(共1200μl)的标准稀释液(0.1% 甲酸,30%乙腈),浓度为50pmol/μl,涡旋震荡至少2min,稍微离心使液体至管底,分装后,-20℃保存;

1.2终溶液:1μl的储液用0.1%FA稀释成1000μl,即终浓度为50fmol/μl,涡旋震荡至少30s,离心至少10s使液体至管底,4℃使用,使用时间为3天
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