主题:【第十三届原创】提高屠宰场非洲猪瘟自检质量应关注的几个问题

浏览0 回复1 电梯直达
栀子花开
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
该帖子已被栀子花开设置为精华; 奖励积分记录: 栀子花开(10分)
维权声明:本文为qzxmsy原创作品,本作者与仪器信息网是该作品合法使用者,该作品暂不对外授权转载。其他任何网站、组织、单位或个人等将该作品在本站以外的任何媒体任何形式出现均属侵权违法行为,我们将追究法律责任。

提高屠宰场非洲猪瘟自检质量应关注的几个问题



1样品采集及保存

1.1样品种类

屠宰企业非洲猪瘟自检首选样品是抗凝血,但抗凝血提取核酸不太方便,且采样成本较高,有的企业改用血浆或血清检测。

对于是否可以采用血浆或血清检测,需要综合考虑以下因素:一是设备,血浆或血清需要采用离心机分离;二是检测过程,抗凝血含有红细胞、血小板及抗凝剂,对提取及扩增有一定影响;而血浆或血清较纯净,对后续处理影响程度较小;三是检测结果,据青岛立见数据,来源相同的情况下,与抗凝血相比,血浆的Ct值增加1左右,血清的Ct值增加2左右。各地可根据具体实际,分析确定采用何种样品。

1.2采样器材

首选采血针/注射器/头皮针+抗凝管,但抗凝管成本高,有的企业改用采血静置分离血浆或血清用于检测。

针对抗凝管价格偏高的问题,可改用“普通离心管+抗凝剂”替代。经查阅资料,一般认为1.5mgEDTA可以阻止1mL血液凝固。为方便采样,一般将EDTA配制成浓度为15g/L的生理盐水溶液,按1/10比例加入离心管,如1.5mL离心管加入0.15mL,可于40左右烘干,也可直接使用。血液注入该离心管后,应颠倒数次将全血与抗凝剂充分混匀。应该注意的是,EDTA浓度过高会影响后续的提取及检测结果。因此,一是要严格按照比例添加抗凝剂,二是加入血液量不足时,要向离心管中补足生理盐水或PBS液。

1.3混样比例

考虑到试剂盒灵敏度,以及企业成本接受能力,混样比例控制在1:10左右较好(粗提),如果采用柱式提取,可将混样比例提高到1:100

是否可以高比例混样,需从以下几个方面考虑:一是对Ct值的影响,相对于疫控机构常用的1:5混样来说,1:20混样Ct值约增加2.01:100混样约增加4.31:500混样约增加6.7。二是对提取效率的影响,在柱式提取中,混样比例过高会导致样品中病毒核酸含量极低,提取柱的吸附膜可能无法与病毒核酸有效结合,导致假阴性;三是对扩增结果的影响,理论上核酸稀释多倍后,只要扩增循环数足够多,仍能检测出阳性结果。但扩增体系中核酸浓度过低时,引物探针可能无法与核酸有效结合,导致假阴性。

1.4样品保存

对于屠宰企业自检后的样品,推荐冷冻保存半年以上。但目前多数企业仅保存一个月左右。根据农业农村部201911月文件,要求对屠宰企业201951日后的留样进行复检。从该文件上可以看出,部级层面是要求留样长期保存的。

1.5留样要足

政府机构实验室普遍采用柱提法提取核酸,取样量一般每次需200μL,因此留样量不宜少于1mL

2核酸提取

2.1提取方式

为了提高核酸提取效率和非洲猪瘟检出率,推荐采用柱式提取。但目前多数企业采用粗提(本人一直反对免提的说法,因为目前市面上的免提试剂盒,实际上还是有核酸提取的试剂和过程,只不过不进行洗脱而已,所以实际上是粗提而不是免提)。

屠宰企业是否可以粗提,需要考虑以下问题:一是粗提后的核酸,含有EDTA等影响后续扩增效果的成分,如果扩增时取样不仔细,还可能吸入红细胞等杂质,影响扩增结果的准确性;二是柱式提取一般取样200μL得核酸50μL,相当于浓缩4倍,而粗提一般取样10μL得核酸混合液210μL,相当于稀释21倍。在其他因素相同的情况下,粗提核酸比柱提结果Ct值约增加6.4。如果叠加上混样比例1:200导致的Ct值约增加5.3,影响值可以达到11.7,绝大多数阳性样品都会出现阴性结果!

结论:高混样比例和粗提,两者只能选其一,且推荐采用柱式提取。

1:5

1:20

1:100

1:500

柱提

首选

 

(以此为基准)

可接受可推荐

 

Ct+2.0

可接受

 

Ct+4.3

可接受不推荐

 

Ct+6.7

粗提

可接受不推荐

 

Ct+6.4

可接受不推荐

 

Ct+8.4

不可接受

 

Ct+10.7

不可接受

 

Ct+13.1



2.2提取器材

一是离心机:不管是柱提还是粗提,均需要使用离心机。因非洲猪瘟病毒是DNA病毒,对温度的影响不太敏感,因此屠宰场自检可不使用冷冻离心机。离心速率建议10000/分以上,条件有限的情况下也可使用6000/分,但时间要延长一倍。建议使用多合一转子,八联管与2mL离心管可以在同一个转子上离心,不必每次更换转子。

二是移液器PCR扩增体系取液量很少,且精度要求高,建议使用进口移液器;柱提取样量较大,可使用国产移液器;粗提取样量较小,建议使用进口移液器

三是移液器吸头:PCR由于扩增效率极高,很容易造成污染,导致假阳性结果。因此在取样、提取和扩增各环节,务必使用滤芯吸头。

2.3提取过程

一是注重防护。提取过程必须穿工作服,戴口罩、手套。在提取过程中,一旦发现或怀疑手套受到污染,应立即更换!

二是环境消毒。此处的消毒,更多的是指使核酸降解,而不是使病毒失去活力。在实验开始前,需用含0.3%有效氯的消毒液喷洒实验台面作用1分钟后用纸巾擦干,然后用75%酒精处理一遍,有条件的可再用DNA祛除剂处理一遍。对移液器等器材也可采用相同方法对外表面进行类似处理。

三是试剂回温。冷冻或冷藏的试剂,应提前取出在室温中静置一段时间,待试剂回到室温后再使用。

四是瞬时离心。所有试剂或样品,在回温后使用前,均需瞬时离心,将液体甩至管底,确保管盖或管壁。有特殊规定不能离心的除外!

五是取样准确。取样前核对移液器量程是否设置正确,插入液体前应将活塞揿到第一阻力位稍向下,吸入液体取出后应检查吸头内是否有气泡,移出液体后应检查吸头内是否还有少量液体。

六是更换吸头。除非向空的离心管内首次加入液体,或移液时不接触离心管及管内液体,否则每加一次液体均应更换吸头。

七是冷却加液。核酸提取过程一般均有加热反应步骤,此步结束后应待管内液体冷却至室温后,方可进行下一步操作。

八是加热洗脱。在柱式提取时,为了提高洗脱效率,建议将活脱液加热到65左右再进行洗脱。因试剂盒附带的洗脱液一般含有EDTA成分,对后续扩增有一定影响,因此建议改用高压灭菌水洗脱。

3核酸扩增及结果分析

核酸扩增过程中应注意问题与提取过程类似,不再赘述。另外应注意:

一是混匀分装。对于非预分装的多组分试剂,在使用前应将所有试剂按需要量加在同一离心管内,混合均匀后瞬时离心,然后均匀分装到八联管内。在加入待检核酸后,同样需要瞬时离心才能放入设备扩增。

二是盖紧管盖。八联管在放入设备扩增前,一定要仔细检查是否盖紧管盖。如未盖紧,一是扩增过程中高温易使试剂蒸发,二是扩增产物会随水汽逸出污染设备加热模块。

三是产物处理。扩增后的八联管,应及时从设备中取出,投入带有含0.3%有效氯的消毒液中,转移至远离实验室的区域反应半小时以上,再作相应处理。

四是结果分析。屠宰企业所用的扩增设备,普遍采用固定阈值来判定结果,相对来说结果分析比较容易。

需要注意的有两点:

一是对于可疑样品如何处理?有的试剂盒规定,Ct值介于35~40的需进行再次检测,如仍出现典型的扩增曲线应判定为阳性。遇到此种情况,一定要对核酸进行再次检测!不能直接判定为阴性!

二是出现一定数量的高Ct值阳性样品如何处理?在经常检测非洲猪瘟的实验室,有时会出现一定比例的高Ct值阳性样品(Ct35以下判定为阳性,出现20%以上Ct30~35的样品),这时不能轻易结果为阳性!很可能是设备、环境受到污染,或者是试剂出了问题!可以参照环境消毒的内容,对实验台面及移液器进行消毒,再次提取核酸进行扩增,出现相同结果可更换另一种试剂进行再测,如还是出现相同结果,可判定为阳性。为慎重起见,也可将样品送至县、市兽医实验室,采用柱提法提取核酸进行扩增,查找出现阳性的原因。

4结果报告

如果检测过程发现阳性样品,一定要按照规定程序及时上报!不得瞒报、迟报、漏报!
为您推荐
您可能想找: 气相色谱仪(GC) 询底价
专属顾问快速对接
立即提交
dadgoh
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
猜你喜欢最新推荐热门推荐更多推荐
品牌合作伙伴