主题:【第二届原创大赛参赛作品】AMDIS自动化质谱图解卷积和鉴定软件在GC/MS数据处理的初步应用

浏览0 回复247 电梯直达
symmacros
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不错的讨论。下面我说明一下在AMDIS中打开岛津数据文件的方法:AMDIS所列岛津数据文件(*.R##)为早期QP5000系列用CLASS5K工作站的数据格式,GCMSSolution下的数据格式为qgd文件,需要在Postrun下打开数据文件,保存成cdf文件,这时在AMDIS下打开cdf文件时可能会出现下面的错误提示:大意是说需要由管理员关闭Fast User Switching。这时只需要用管理员进入windows,在控制面板----用户帐户----更换用户登录或注消的方式----去掉“使用快速用户切换”前面的钩。就可以正常打开qgd文件了。
之前一直以为AMDIS是安捷伦的软件。


Amdis可以用于大部分主流仪器厂商的数据处理。
相对于仪器的软件有什么好处吗?


只要是处理复杂成分或复杂基质样品的质谱数据,可以从大峰里面找出被掩盖的小成分,混合共流峰的剥离,低于基线或漂移基线里的小成分等。
砂锅粥
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warmphy
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你好,首先非常感谢你的文章,我受益非浅。自己看那个英文说明书真是头大!然后我请教一个问题:
1、通过进一针正构烷烃的混合标准,然后生成一个保留时间指数校正文件,然后自己进一针检样,出来比如几十个峰,然后每个峰它会自动计算保留时间指数,但是如果你自建的库是不带保留时间指数的,是不是就没用?而且AMDIS自带的好几个库如环境库,武器库,毒物库等大部分的化合物都没有标保留时间指数,所以这项工作是不是没意义。我原来是进了很多我们行业的标样,然后编辑成一个AMDIS自建库,然后在每个标准的旁边挂号里标上保留时间,当进一个检样自动搜索后,若出峰时间和我自建库里的比对中的东西的时间不一致,我就认为不是这个东西,这个好像和保留时间指数的功能一样。如果我现在要用这个保留时间指数的功能,我是不是要重新把我所有的标准都进一遍,然后才能得出每个标准的保留时间指数?
2、把别人建好的自建库里的每个标准的保留时间指数都拷贝过来,仪器条件和方法不一样的话是不是没用?
symmacros
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原文由 warmphy(warmphy) 发表:
你好,首先非常感谢你的文章,我受益非浅。自己看那个英文说明书真是头大!然后我请教一个问题:
1、通过进一针正构烷烃的混合标准,然后生成一个保留时间指数校正文件,然后自己进一针检样,出来比如几十个峰,然后每个峰它会自动计算保留时间指数,但是如果你自建的库是不带保留时间指数的,是不是就没用?而且AMDIS自带的好几个库如环境库,武器库,毒物库等大部分的化合物都没有标保留时间指数,所以这项工作是不是没意义。我原来是进了很多我们行业的标样,然后编辑成一个AMDIS自建库,然后在每个标准的旁边挂号里标上保留时间,当进一个检样自动搜索后,若出峰时间和我自建库里的比对中的东西的时间不一致,我就认为不是这个东西,这个好像和保留时间指数的功能一样。如果我现在要用这个保留时间指数的功能,我是不是要重新把我所有的标准都进一遍,然后才能得出每个标准的保留时间指数?
2、把别人建好的自建库里的每个标准的保留时间指数都拷贝过来,仪器条件和方法不一样的话是不是没用?


1, 如果自建的库是不带保留时间指数的,就不能在Amdis上进行自动保留指数校对。你自编库在每个标准的旁边挂号里标上保留时间,也可以,检索校验无问题,但是是人工的因素多一点。现在要用这个保留时间指数的功能,也不一定要重新把我所有的标准都进一遍,然后才能得出每个标准的保留时间指数,只要你知道保留指数你可以加进去。

2, 相同的柱子,保留指数是基本不变的,可以把别人建好的自建库里的每个标准的保留时间指数都拷贝过来用。
一鹤凌云
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感谢你的分享,请问NISTFF NISTTOX NISTFDA 等都各代表什么?
symmacros
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原文由 一鹤凌云(houyipin) 发表:
感谢你的分享,请问NISTFF NISTTOX NISTFDA 等都各代表什么?


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2012/3/7 14:17:25 Last edit by jimzhu
一鹤凌云
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谢谢!
原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
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2012/4/9 16:15:39 Last edit by czcht
mazi007
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sallybear
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请教一下楼主,报告中amount的具体含义是什么?手册中的定义我看的不太懂,amount和TIC图中纵坐标abundance有什么关系?
十分感谢!
hw0178
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不知道楼主现在安装了最新的2.71版本没有,感觉有点变化了,方便的话能否针对最新版本做些介绍呢?另外,想请教下,怎样才能看到重叠峰里的组分数和各自的积分面积?我是新手,谢谢老师了
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