另外一个问题是有些农药在环境中的沉积,可能使环境受到污染,包括土壤、大气和水,特别是作为饮用水源的地下水中的农药渗入量已引起高度重视。在土壤中的沉积是田间喷酒农药时的药液流失、土壤药剂处理或化学灌溉(chemigation)、以及使用后所抛撒的废弃农药所造成。上层土壤中的农药沉积物如果继续向下层移动即可能进入地下水。进入大气的农药可能有两个来源:一是农药的超细微粒,在大气中能飘是很长时间难以降落;二是蒸气压较高的农药的散发的蒸气可以混存在大气中。
农药对环境的这几种污染途径和污染方式,在生命科学、环境科学、卫生科学中都引起了高度关注和重视。尤其值得注意的是在广大人民群众中业已造成了极大的影响,可以说达到了“谈‘药’色变”的地步。特别对于蔬菜、水果等食用农产品以及饮用水,几乎人人都担。已有“农药污染”问题。在市场、广告上也大力宣传这种污染问题,并推销一些据说能够“洗掉”农药残留物的药水和检出农药残留物的快速检测纸。可是这种宣传只不过给了消费者以一种安慰而已;实际情况是很可疑的,因为现在还没有这样的清洗剂能够清洗掉任何农药残留物,或快速检测出任何农药残留。