四、使用软件测量
说到这里,才算是提到了图像分析软件了。
实际上Image-pro plus不过是许多种图像分析软件中的一种。它是一种通用的图像分析软件,不仅是用在生物图像分析上,在其他场合用得更多。其优势当然是功能强大,操作也顺手。缺点只有一个,就是贵。请大家不要在此场合讨论非正版软件的问题,这不符合丁香园网站的规定。
通用的软件适合于多种场合下的应用,专用的软件则有特定的应用场合,比如凝胶电泳分析软件,它的功能范围远比不上通用的图像分析软件,但是在分析凝胶电泳图片时,它却非常方便。这次既然提到了关于RT-PCR凝胶图片的分析及Western blot膜的分析,就得提到Image-pro plus的姊妹软件:gel-pro。如果使用IPP来分析电泳图片,恐怕会相当麻烦而且结果会比较粗糙。用gel-pro来分析就轻松得多了。
Image J也是图像分析软件。与IPP的功能类似,操作当然有不同。优点是能自己编制处理功能,但要作到这一点却是有难度的。
专门分析凝胶图片的软件是很多的。常用的除了gel-pro之外,还有bandscan,quantity one, visionworks等,它们大多是与凝胶拍摄系统一起购买使用的。分析原理都一样,操作上略有不同,功能基本上都差不多,用哪个都行的。用惯了IPP,再用gel-pro会熟悉一些。
使用凝胶电泳分析软件可以分析DNA凝胶图片,RNA凝胶图片,蛋白质的凝胶电泳图片,Western blot膜的照片,化学发光作的Western blot胶片等。
具体的软件操作步骤不是本讲座的重点。在另外文章里,有关于Image pro plus以及 gel-pro软件的详细具体的操作方法。