主题:【已应助】质谱数据如何相对定量?

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kuerten110
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我们打算开展组学实验,前阵子我们弄了些细胞脂质提取物(细胞有2种,正常的和基因突变的,我们各提取了相同数量的细胞的脂质),找人用AB的TOF 5600做了LC-MS,用lipidview软件分析能发现检测到上万种不同的脂类,我们想看看哪些脂质含量发生了变化,analyst和lipidview软件我们都有,因为我们没有用任何标准品(目前只是想先看看哪些脂类含量发生了变化),我们现在不知道该如何进行组间相对定量,有哪位老师知道这样的数据该怎么相对定量吗?(就是能找出2组样本中含量有差异的就行)
先谢谢大家了!
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八杯水
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(就是能找出2组样本中含量有差异的就行)??
那同一条件下,对比同样进样量的峰面积或者离子丰度不就可以了吗?回答得太简单,别见笑啊。
kuerten110
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(就是能找出2组样本中含量有差异的就行)??

那同一条件下,对比同样进样量的峰面积或者离子丰度不就可以了吗?回答得太简单,别见笑啊。


首先谢谢您的回答,这个机器给的数据我用lipidview分析后可以选择是peak intensity 或者是peak area,但是有个人给我讲说这个出来的是质谱峰强度,不是那个真正的物质含量,说要是定量还得去还原那个液相的数据,是这样吗?
八杯水
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(就是能找出2组样本中含量有差异的就行)??

那同一条件下,对比同样进样量的峰面积或者离子丰度不就可以了吗?回答得太简单,别见笑啊。


首先谢谢您的回答,这个机器给的数据我用lipidview分析后可以选择是peak intensity 或者是peak area,但是有个人给我讲说这个出来的是质谱峰强度,不是那个真正的物质含量,说要是定量还得去还原那个液相的数据,是这样吗?


同一条件下,同一个物质的峰强度难道不是跟该物质的含量成正比关系吗?
kuerten110
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我也是这样认为,但是我又一次打听了一个工程师,他给我的答案是否定的,我不是化学出身的,所以感觉疑惑,才来问高手的
ie4680180
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kuerten110
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是这样,我们的目的是先看看有多少表达有差异的脂质,算是大海捞针啊,内标根本就没法加,总不能加上万种吧?哎,要是那个峰强度或者是峰面积能代表相对量是多少就好了。
ie4680180
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哦,是这样啊。
峰强度或者峰面积为什么不能代表相对量是多少?我们平时定量都是根据他们来的啊。
netsking
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(就是能找出2组样本中含量有差异的就行)??

那同一条件下,对比同样进样量的峰面积或者离子丰度不就可以了吗?回答得太简单,别见笑啊。


首先谢谢您的回答,这个机器给的数据我用lipidview分析后可以选择是peak intensity 或者是peak area,但是有个人给我讲说这个出来的是质谱峰强度,不是那个真正的物质含量,说要是定量还得去还原那个液相的数据,是这样吗?


同一条件下,同一个物质的峰强度难道不是跟该物质的含量成正比关系吗?


这个问题的答案如上说的, 是也不是. 由于样品每次进样的离子化都会引起不同的向应, 所以同一样品不同的进样出来的结果就有差异. 最好的方法是假内标, 所有的信号都与内标比就可以了
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(就是能找出2组样本中含量有差异的就行)??

那同一条件下,对比同样进样量的峰面积或者离子丰度不就可以了吗?回答得太简单,别见笑啊。


首先谢谢您的回答,这个机器给的数据我用lipidview分析后可以选择是peak intensity 或者是peak area,但是有个人给我讲说这个出来的是质谱峰强度,不是那个真正的物质含量,说要是定量还得去还原那个液相的数据,是这样吗?


同一条件下,同一个物质的峰强度难道不是跟该物质的含量成正比关系吗?


这个问题的答案如上说的, 是也不是. 由于样品每次进样的离子化都会引起不同的向应, 所以同一样品不同的进样出来的结果就有差异. 最好的方法是假内标, 所有的信号都与内标比就可以了


您好,非常感谢您的回答,这个假的内标该如何找呢?有什么要求吗
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