高真空、无泄漏是调谐以及正常检测的基础，调谐之前按惯例要进行空气/水的检查(没有安装真空规)。打开“System Control”并进入“Auto Tune”界面，单选“Air/Water check”后点“Start Auto Tune”，显示如下图：
结果为：空气峰Mass 28 Peak Width：1.9m/z；水峰19/18 Ratio Value 35.3% ，不合格（标准为：空气峰Mass 28 Peak Width小于1.0m/z；水峰19/18 Ratio Value小于 20%）。说明有空气泄漏，需要找到泄漏点。一般漏点主要集中在进样口、色谱柱柱头及柱尾的连接处，由于柱头及柱尾的石墨垫所处的高温环境（尤其是柱头所在的柱温箱要反复升降温度），所以重点考察部位放在了柱头及柱尾处，于是拿小扳手紧了紧柱头及柱尾的螺母，感觉很紧不像漏气；又去查看进样口螺帽时，问题找到了：原来昨天在更换了进样隔垫后，只用手将螺帽拧紧，而未用小扳手拧紧（当时有客户参观，可能分神了）。用小扳手拧紧，又抽真空1小时后，再进行“空气/水检查”，结果为：空气峰Mass 28 Peak Width：0.8m/z；水峰19/18 Ratio Value 16.4% ，OK，合格，见下图：
在波形板的前端将跳线XW4拔下并放置L一端（原跳线位于I端），单选“Electron Multiplier Tune”，并点“Start Auto Tune”，若显示Setting is High（或Low）则调节电阻R66，见下图：
每调一次电阻，就点一次调谐，使Average Counts 的值在0.50±0.2范围内即可，顺时针旋转变大，逆时针旋转变小（原版说明说反了），直至显示OK后，它将继续进行电子倍增器电压的调谐，点Reset，再将跳线XW4放回I端后，点“Start Auto Tune”，若显示Setting is High（或Low）则调节电阻R20，方法同上，也使Average Counts 的值在0.50±0.2范围内，调节成功后显示类似如下提示：
Integrator Zero Set: Setting is OK (Setting: 128, Average Counts: 0.50) Integrator Zero Set: Completed
经过调节，积分零点设定OK，并顺利通过了电子倍增器电压的调谐。下一步进行校正气的质量校正。
四、 自动调谐之RF全标尺调节
在“Auto Tune”界面中，单选“FC-43 Mass Calibration”，点“Start Auto Tune”，开始进行校正气的质量校正，以保证有正确的质量分配，结果显示：RF Full Scale Adj: Setting is low。
进入Manual Control 界面中，激活一个方法文件并进入第二片段（Scan扫描方式，50-650amu）， 打开阱和校正气，放大每个离子峰（69、264、464、502、614），从69开始，调节电阻R38直到69峰位于69±1的质荷比中心位置，调整好后，重复以上过程调整每一个离子峰，直到614峰也调整好。电阻R38在分子涡轮泵下面的一块电路板上，见下图：
调节时要从小到大依次调节，不可再返回去调节。调整完后，再回到“Auto Tune”界面中，单独运行“FC-43 Mass Calibration”，以确认每一个离子峰都能找到并有恰当的质量分配。
奇怪的是我在调节质量峰时只找到了69离子峰，而其它离子峰找不到，没有离子峰如何调节？难道是离子阱温度（200℃）较高导致高质量离子比例降低？可是以前也是这样调节的，没见过这次这么费劲，很郁闷。因为有其它事，出去了一会儿，回来后，另一位同事告诉我，刚才她看了一下校正气，仅显示一个蓝格，问题找到了，因为校正气针阀开的小，导致校正气不能顺畅到达检测器，因而不能找到校正气的离子。可能是因为电路板老化的原因，原来显示的校正气ok只是一种假象（反应迟缓），需要多等会儿才能正确反映出校正气的真实状况。再一次重新调节校正气（多等会儿），直至ok状态（中间位置）后，运行“FC-43 Mass Calibration”，顺利通过，最后是阱功能校正，也顺利通过，总算调谐完成，允许进样了。
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，没办法，只好拆阱重新安上。
工程师解释说，温度上不去的原因有可能是传输线内测量温度的热电偶没有插到铝柱体上的小孔内合适的位置而造成（可是我感觉安装很到位），并建议最好换个新的（他们就愿意干这事）。
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