主题:【求助】GCMS数据分析时的定性匹配度

浏览0 回复16 电梯直达
勇勇君君
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
在此谢谢各位大侠,涨了知识了:单凭匹配度是不能确定物质的,最多说明可能性。我准备通过再用其它极性柱子以及可找的标样,来进行分析确认。
luos86
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
原文由 symmacros(jimzhu)发表:安捷伦的工作站使用PBM检索,属于反向检索。

关于 PBM
PBM 是指基于概率匹配(probability-based matching)的算法,该算法是由康奈尔大学的 Fred McLafferty 教授及其合作者共同开发的一个谱库检索程序。

该算法使用逆谱库检索来验证未知光谱中是否存在参比质谱中的峰。检索过程中忽略其他峰,从而实现对化合物混合物的质谱进行分析。

质谱的各个荷质比 (m/z) 值的出现概率并不相同,因此 PBM 算法同时使用质量值和丰度值来识别参比光谱中最有效的峰。向谱库添加质谱时,系统使用这些峰生成压缩参比光谱,以供 PBM 检索程序使用。

随后,检索程序中的预过滤器会为未知质谱中的每个峰分配有效性,并根据有效性在压缩参比质谱中查找最可能的匹配。程序使用上面提到的逆谱库检索对所选压缩光谱与未知质谱进行比较。当使用默认策略参数时,预过滤器可以将数据库中大约 95% 的化合物直接排除,极大地提高了检索速度。
听说岛津GCMS Solution的检索算法跟安捷伦不一样,检索结果比较准,是这样的吗?
zhengbang17
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
symmacros
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
原文由 luos86(v2905367)发表:
原文由 symmacros(jimzhu)发表:安捷伦的工作站使用PBM检索,属于反向检索。

关于 PBM
PBM 是指基于概率匹配(probability-based matching)的算法,该算法是由康奈尔大学的 Fred McLafferty 教授及其合作者共同开发的一个谱库检索程序。

该算法使用逆谱库检索来验证未知光谱中是否存在参比质谱中的峰。检索过程中忽略其他峰,从而实现对化合物混合物的质谱进行分析。

质谱的各个荷质比 (m/z) 值的出现概率并不相同,因此 PBM 算法同时使用质量值和丰度值来识别参比光谱中最有效的峰。向谱库添加质谱时,系统使用这些峰生成压缩参比光谱,以供 PBM 检索程序使用。

随后,检索程序中的预过滤器会为未知质谱中的每个峰分配有效性,并根据有效性在压缩参比质谱中查找最可能的匹配。程序使用上面提到的逆谱库检索对所选压缩光谱与未知质谱进行比较。当使用默认策略参数时,预过滤器可以将数据库中大约 95% 的化合物直接排除,极大地提高了检索速度。
听说岛津GCMS Solution的检索算法跟安捷伦不一样,检索结果比较准,是这样的吗?
这个不知道,可以用用一个样试试看。
symmacros
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
原文由 勇勇君君(v3117928) 发表:
在此谢谢各位大侠,涨了知识了:单凭匹配度是不能确定物质的,最多说明可能性。我准备通过再用其它极性柱子以及可找的标样,来进行分析确认。
一般需要保留时间或保留指数或标样来确认,也可以通过不同极性柱子来确认。
千层峰
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
原文由 勇勇君君(v3117928)发表:在此谢谢各位大侠,涨了知识了:单凭匹配度是不能确定物质的,最多说明可能性。我准备通过再用其它极性柱子以及可找的标样,来进行分析确认。
参考作用还是有的,毕竟是判断的一个重要依据
猜你喜欢最新推荐热门推荐更多推荐
品牌合作伙伴