原文由 symmacros(jimzhu)发表:安捷伦的工作站使用PBM检索,属于反向检索。听说岛津GCMS Solution的检索算法跟安捷伦不一样,检索结果比较准,是这样的吗?
关于 PBM
PBM 是指基于概率匹配(probability-based matching)的算法,该算法是由康奈尔大学的 Fred McLafferty 教授及其合作者共同开发的一个谱库检索程序。
该算法使用逆谱库检索来验证未知光谱中是否存在参比质谱中的峰。检索过程中忽略其他峰,从而实现对化合物混合物的质谱进行分析。
质谱的各个荷质比 (m/z) 值的出现概率并不相同,因此 PBM 算法同时使用质量值和丰度值来识别参比光谱中最有效的峰。向谱库添加质谱时,系统使用这些峰生成压缩参比光谱,以供 PBM 检索程序使用。
随后,检索程序中的预过滤器会为未知质谱中的每个峰分配有效性,并根据有效性在压缩参比质谱中查找最可能的匹配。程序使用上面提到的逆谱库检索对所选压缩光谱与未知质谱进行比较。当使用默认策略参数时,预过滤器可以将数据库中大约 95% 的化合物直接排除,极大地提高了检索速度。
原文由 luos86(v2905367)发表:这个不知道,可以用用一个样试试看。原文由 symmacros(jimzhu)发表:安捷伦的工作站使用PBM检索,属于反向检索。听说岛津GCMS Solution的检索算法跟安捷伦不一样,检索结果比较准,是这样的吗?
关于 PBM
PBM 是指基于概率匹配(probability-based matching)的算法,该算法是由康奈尔大学的 Fred McLafferty 教授及其合作者共同开发的一个谱库检索程序。
该算法使用逆谱库检索来验证未知光谱中是否存在参比质谱中的峰。检索过程中忽略其他峰,从而实现对化合物混合物的质谱进行分析。
质谱的各个荷质比 (m/z) 值的出现概率并不相同,因此 PBM 算法同时使用质量值和丰度值来识别参比光谱中最有效的峰。向谱库添加质谱时,系统使用这些峰生成压缩参比光谱,以供 PBM 检索程序使用。
随后,检索程序中的预过滤器会为未知质谱中的每个峰分配有效性,并根据有效性在压缩参比质谱中查找最可能的匹配。程序使用上面提到的逆谱库检索对所选压缩光谱与未知质谱进行比较。当使用默认策略参数时,预过滤器可以将数据库中大约 95% 的化合物直接排除,极大地提高了检索速度。