保护柱可以除去样品及流动相中的颗粒,也可以防止分析柱被有害化学物质损坏。很好的利用保护柱能延长正常色谱使寿命是非经济有效措施。但加上保护柱以后相当于增了色谱分析长度,会导致系统压力升高,影响泵的使用寿命;也会延长待测物保留时间,降低工作效率;由于保护柱长度相对较短,理论塔板数较低,所以保护柱在用过一段时间后容易出现拖尾或杂峰,这就应更换保护柱了。色谱柱前端的保护柱不是必备品,这里需要考量权衡保护柱与色谱损耗的平衡,加不保护柱要看样品和色谱柱本身。对于比较便宜的色谱柱,保护性价比就不高了,可以不使用保护。另外硅胶寿命本身就非常短,这样的色谱柱也可以不使用保护,意义不大。反过来说,对于需要延长使用寿命的聚合物基质色谱柱保护还是非常有效果的。超高效
液相色谱柱填料粒径非常小,样品脏的话很容易造成堵塞和残留,价格也比普通色谱柱贵很多,最好在前端加装保护。保护柱填料一般与色谱柱是有一些区别的(主要是粒径方面),但不同厂家的保护柱(填料相同)一般情况下可以通用。