原文由 freeboy77 发表:
>请问做生物大分子,如多肽和蛋白,一般浓度为多少比较合适?
1mM左右。在没有聚合的情况下,越高越好
>是否需要用H2O/D2O=90%:10%做溶剂?D2O不会把活泼H交换掉么?
不是必须的。10%的D2O只会交换掉少部分的活泼氢,影响不大。而且可以降至5%
>是否需要做与生理条件类似的缓冲溶液?
不一定。根据样品需要。
>二维COSY/TOCSY/NOESY或ROESY谱图怎么压水峰?
很多种方法,取决于你使用的程序。常见的有预饱和,3919等
>一般做NOESY的时候混和时间取多少比较合适?
取决于分子量大小。小肽可以做到400-500ms,100氨基酸的大分子在100ms左右
另外,二维谱1H解析蛋白质,通常最多只能做到70个氨基酸大小的蛋白
更大的需要使用同位素标记,三维谱
原文由 freeboy77 发表:
>请问做生物大分子,如多肽和蛋白,一般浓度为多少比较合适?
1mM左右。在没有聚合的情况下,越高越好
>是否需要用H2O/D2O=90%:10%做溶剂?D2O不会把活泼H交换掉么?
不是必须的。10%的D2O只会交换掉少部分的活泼氢,影响不大。而且可以降至5%
>是否需要做与生理条件类似的缓冲溶液?
不一定。根据样品需要。
>二维COSY/TOCSY/NOESY或ROESY谱图怎么压水峰?
很多种方法,取决于你使用的程序。常见的有预饱和,3919等
>一般做NOESY的时候混和时间取多少比较合适?
取决于分子量大小。小肽可以做到400-500ms,100氨基酸的大分子在100ms左右
另外,二维谱1H解析蛋白质,通常最多只能做到70个氨基酸大小的蛋白
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同核谱真的可以达到70个吗??在600MHz谱仪实际操作中50个好像已经很难了
更大的需要使用同位素标记,三维谱
原文由 freeboy77 发表:
>>另外,二维谱1H解析蛋白质,通常最多只能做到70个氨基酸大小的蛋白
>> ~~~~~~~~~~~~
>> 同核谱真的可以达到70个吗??在600MHz谱仪实际操作中50个好像已经很难了
原则上是可以的,当然也取决于蛋白质的性质
比如Biochemistry 1998, 37, 9641-9649 是80个氨基酸
Eur. J. Biochem. 258, 502-514 (1998)是77个氨基酸
不过这两个使用了750M和800M的谱仪
Biochemistry 1992, 31, 1011-1020是78个氨基酸在500M上做的
国内生物物理所的Biochimica et Biophysica Acta 1594 (2002) 353-363也做了62个氨基酸的蛋白,使用600M
在PDB中搜索一下应该还有很多同核二维做到70个氨基酸的例子
原文由 nmrviewer 发表:原文由 freeboy77 发表:
>>另外,二维谱1H解析蛋白质,通常最多只能做到70个氨基酸大小的蛋白
>> ~~~~~~~~~~~~
>> 同核谱真的可以达到70个吗??在600MHz谱仪实际操作中50个好像已经很难了
原则上是可以的,当然也取决于蛋白质的性质
比如Biochemistry 1998, 37, 9641-9649 是80个氨基酸
Eur. J. Biochem. 258, 502-514 (1998)是77个氨基酸
不过这两个使用了750M和800M的谱仪
Biochemistry 1992, 31, 1011-1020是78个氨基酸在500M上做的
国内生物物理所的Biochimica et Biophysica Acta 1594 (2002) 353-363也做了62个氨基酸的蛋白,使用600M
在PDB中搜索一下应该还有很多同核二维做到70个氨基酸的例子
顶!
受益非浅。请问你用那套软件来处理、分析、指认和计算?谢了。