主题:【求助】请教高手:贝克曼毛细管电泳如何实现DNA的检测

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katherine7
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原文由 jcok123(jcok123) 发表:
原文由 katherine7(katherine7) 发表:
请教高手:贝克曼毛细管电泳如何实现DNA的检测
要分离的是180-250bp整数倍的DNA片段
该以什么为标准品来进行检测呢?
现在在尝试用100bp DNA ladder用检测,但始终分离不出来
不知道是不是因为缓冲体系不好
目前用的是75μm的柱子,缓冲液0.1M 硼酸+ 0.1M Tris


给你介绍一篇我们课题组发表的文献吧,应该对你有帮助

Tetrabutylammonium phosphate-assisted separation of multiplex PCR products
in non-gel sieving capillary electrophoresis

非常感谢,
katherine7
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请教高手:贝克曼毛细管电泳如何实现DNA的检测
要分离的是180-250bp整数倍的DNA片段
该以什么为标准品来进行检测呢?
现在在尝试用100bp DNA ladder用检测,但始终分离不出来
不知道是不是因为缓冲体系不好
目前用的是75μm的柱子,缓冲液0.1M 硼酸+ 0.1M Tris


给你介绍一篇我们课题组发表的文献吧,应该对你有帮助

Tetrabutylammonium phosphate-assisted separation of multiplex PCR products
in non-gel sieving capillary electrophoresis


非常感谢
katherine7
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原文由 heguang(heguang) 发表:
你的缓冲体系里面为什么没有看到凝胶?Tris-硼砂的体系用来分离dsDNA是没有错,但是你一定要加凝胶进去的,没有凝胶,你怎么把不同长短的DNA分开呢?同时你还要考虑DNA在毛细管内壁吸附的问题,如果你用裸管做,你就要用有动态吸附性质的凝胶,PVP效果不错;如果你用的没有动态涂层作用的凝胶,你就必须要用涂层毛细管做。毛细管长短不是关键,一般分DNA的毛细管40-50cm足够,75um也没有问题(LIF检测),如果紫外检测就用100um。

首先,谢谢你的回复,你的信息对我很有帮助。
凝胶这个问题,已经考虑到了,但是看文献中好像提到,凝胶分离不如无胶筛分好, 可是究竟如何来操作,还没闹明白!
katherine7
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原文由 poplar_yang(poplar_yang) 发表:
原文由 katherine7(katherine7) 发表:
那请问,除了改用毛细管长住外,在分离DNA时,缓冲体系上是否要用硼酸来调pH呢?


pH值需要计算; 可设置楼梯; 硼酸可以pH4-12, NaH2PO4可以pH1-9等等


是否意味着,若配置硼酸缓冲体系,就用硼酸来调节pH值?
katherine7
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原文由 heguang(heguang) 发表:
你的缓冲体系里面为什么没有看到凝胶?Tris-硼砂的体系用来分离dsDNA是没有错,但是你一定要加凝胶进去的,没有凝胶,你怎么把不同长短的DNA分开呢?同时你还要考虑DNA在毛细管内壁吸附的问题,如果你用裸管做,你就要用有动态吸附性质的凝胶,PVP效果不错;如果你用的没有动态涂层作用的凝胶,你就必须要用涂层毛细管做。毛细管长短不是关键,一般分DNA的毛细管40-50cm足够,75um也没有问题(LIF检测),如果紫外检测就用100um。


动态吸附性质,具体怎么理解,我文献阅读时,就没弄明白。
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