主题：【求助】正构烷烃混标

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为什么天然烃都是奇数碳，天然羧酸跟天然脂肪醇都是偶数碳？

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HaoX

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关于前半句，你应该指的是天然正构烷烃吧。因为奇偶性对于非烷烃没什么意义。比如下面这个玩意
分子式，是一种很重要的单萜(monoterpene)，全球生物向大气排放第二多的有机物。
生物产生的正构烷烃确实很常见的奇偶效应——烷烃序列中奇数碳远远高于偶数碳。但是这个只是在植物中比较常见。细菌和海洋藻类的烷烃就常常不存在这个现象了。这些存在奇偶效应的植物中烷烃的合成途径大概是这样的：
简单来说就是脂肪酸，脂肪醇这些化合物的去官能团化。在这个过程把端基的那个碳给丢掉了，于是偶数碳的脂肪酸就变成了奇数碳的烷烃。

天然的绝大多数脂肪酸都是偶数碳——这也是由它的生物合成过程决定的。要想得到向上图那样一个长链脂肪酸，得先从一个酰基辅酶A（Acetyl-CoA）开始，加上一个丙二酰辅酶A（Malonyl-CoA），通过酰基载体蛋白拼在一起脱掉一个二氧化碳，形成一个四个碳的链。再由NADPH一步一步把左边那个酮基还原成饱和碳。接下来的过程就是不断重复 丙二酰载体蛋白聚合-NADPH还原 的过程，链上的碳数+2+2+2+2+2...最后我们就会得到一个长长的，偶数碳的脂肪酸。

为什么天然烃都是奇数碳，天然羧酸跟天然脂肪醇都是偶数碳？
关于前半句，你应该指的是天然正构烷烃吧。因为奇偶性对于非烷烃没什么意义。比如下面这个玩意
分子式，是一种很重要的单萜(monoterpene)，全球生物向大气排放第二多的有机物。
生物产生的正构烷烃确实很常见的奇偶效应——烷烃序列中奇数碳远远高于偶数碳。但是这个只是在植物中比较常见。细菌和海洋藻类的烷烃就常常不存在这个现象了。这些存在奇偶效应的植物中烷烃的合成途径大概是这样的：
简单来说就是脂肪酸，脂肪醇这些化合物的去官能团化。在这个过程把端基的那个碳给丢掉了，于是偶数碳的脂肪酸就变成了奇数碳的烷烃。

天然的绝大多数脂肪酸都是偶数碳——这也是由它的生物合成过程决定的。要想得到向上图那样一个长链脂肪酸，得先从一个酰基辅酶A（Acetyl-CoA）开始，加上一个丙二酰辅酶A（Malonyl-CoA），通过酰基载体蛋白拼在一起脱掉一个二氧化碳，形成一个四个碳的链。再由NADPH一步一步把左边那个酮基还原成饱和碳。接下来的过程就是不断重复 丙二酰载体蛋白聚合-NADPH还原 的过程，链上的碳数+2+2+2+2+2...最后我们就会得到一个长长的，偶数碳的脂肪酸。

作为强有力的分离和鉴定复杂混合物的分析手段，GCMS已广泛应用于许多领域。特别在天然香精油，香气香味产品的分析鉴定有明显的优势。

　　MS 鉴定未知物最常用的办法就是未知物的质谱与质谱数据库中标准谱图进行对比。基于相似度，检索功能可提供一个按相似系数由高到低的匹配列表。相似度越大，检索的正确的可能性就越高。正如众所周知，充满挥发性香气香味成分的植物的提取物，香精油等天然材料的复杂机体含大量的萜(烯)化合物，即由异戊二烯单元组成烯类，如单萜，二萜，倍半萜，双萜烯类化合物，及其含氧衍生物，如醇类，醛类，酮类，酯类，醚类，氧化物等的复杂混合物。同分异构体有着相似的质谱图，其质谱裂解出非常相似的碎片，用质谱数据谱库PBM检索就难以识别。例如，甲位蒎烯和乙位蒎烯这两个异构体的质谱图非常接近，在PBM检索时，给出的结果可能把甲位判断成乙位。再例如，柠檬醛的两个异构体橙花醛和香叶醛，橙花醇和香叶醇等等也有同样问题。许多醇和及其酯的大部分离子碎片也相同。脂肪醇和直链烯烃的质谱图非常相似。三个二甲苯的邻，间，对异构体也非常相似。有时候，即是匹配度很高，也无法断定检索的结果是否正确。有时候检索到的几个化合物的匹配度都很高，也很接近，究竟选哪一个呢?对于异构体，同系物和结构特征相似的化合物，由于其质谱图非常相似，谱库检索结果匹配度，排列次序都很接近，检索给出的顺序也不一定正确。但它们的保留时间可能会不同，但保留时间只能在特定色谱条件下不变，而保留指数在固定相相同下有可比性。虽然在相同的柱子上和相同的色谱条件下，两个不同的化合物的保留指数有可能相同。但两个化合物同时具有相同的保留指数(或保留时间)和相同的质谱图的不可能性极小。所以在谱库检索的基础上，用保留指数来确认结果。是一种很重要的手段。

　　下面是甲位蒎烯和乙位蒎烯这两个异构体的质谱图，差别不是很大。电脑检索时是难以区分的。

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　　上面几个质谱相似化合物对例子的保留指数差别如下表。

　　保留时间应用举例

　　RI(极性柱) RI(非极性柱)

　　甲位蒎烯 1045 941

　　乙位蒎烯 1125 980

　　橙花醛 1674 1215

　　香叶醛 1722 1242

　　橙花醇 1793 1212

　　香叶醇 1846 1236

　　保留指数的计算

　　保留指数retention index或Kovats Index(RI或KI)概念是由Kovats在1958年提出。是把组分的保留值用两个分别前后靠近它的正构烷烃来标定(这比仅用一个参比物质的相对保留值定向更为精确)。正构烷烃的保留指数规定为等于该烷烃分子中碳原子数的100倍。例如正己烷的RI为600，正庚烷为700，正十五烷为1500.正构烷烃的RI与所用的色谱柱，柱温及其它操作条件无关。

　　保留指数(RI)的计算公式如下：

　　I=100Z+100[logt’R(x)- logt’R(z)]/ [logt’R(z+1)- logt’R(z)] (恒温分析)

　　式中：t’R为校正保留时间;

　　Z和Z+1分别为目标化合物(X)流出前后的正构烷烃所含碳原子的数目;

　　这里：t’R(z) < t’R(x)< t’R(z+1), 一般正构烷烃所含碳原子的数目Z大于4.

　　以上的保留指数(RI)的计算只用于恒温分析。对于沸点范围较宽的复杂组分混合物的分析，一般采用程序升温的方法。在程序升温时，组分的保留指数的测定有所不同。两者有差异，需要校正。

　　1963年Van Den Dool 等经过推算(详细的推导过程略)引入线性程序升温保留指数的概念。

　　IT=100Z+100[TR(x)-TR(z)]/ [TR(z+1)-TR(z)] (线性程序升温)

　　式中：TR(x)，TR(z)，TR(z+1)分别代表组分及碳数为Z，Z+1正构烷的保留温度。且TR(z)< TR(x)[tr]< p>?
　　一般讲，保留温度的测量比保留时间的测定要麻烦一点。由于保留温度和保留时间通常具有高度的相关性，所以用保留时间代替上式中的保留温度来进行计算保留指数。

　　可以手动来计算保留指数。现在一般是由相关软件利用正构烷烃的保留时间来自动计算完成。例如有的工作站或第三方软件里面带有计算保留指数功能。

　　保留指数的测定

　　1.首先在与样品分析相同的色谱条件下，进正构烷烃的混合物标样。例如C6-C30， 浓度0.1%。一般购买标准混合物(便宜)或购单标样自己配制(较贵)。下面是用C6-C26得到的正构烷烃的色谱图。

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　　2. 在分析相同的色谱条件下，进所要测得组分的混合物或单样。测得保留时间。

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　　用IT=100Z+100[TR(x)-TR(z)]/ [TR(z+1)-TR(z)]式计算出保留指数。

　　例如图中柠檬烯limonene的保留时间为9.61min，其前后的正构烷烃分别为C12(9.41min)和C13(12.61min). 则柠檬烯得保留指数为：IT=100Z+100[TR(x)-TR(z)]/ [TR(z+1)-TR(z)]=100*12+100(9.65-9.41)/(12.61-9.41)=1207

　　通过相同的方法，得到其它组分的保留指数备用。也可以把保留指数存放在MS谱库里面的retention index选项下面或其它地方备用调用。

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　　保留指数与保留时间的转换

　　从IT=100Z+100[TR(x)-TR(z)]/ [TR(z+1)-TR(z)]式可以导出：

　　TR(x)= [IT-100Z]*[TR(z+1)-TR(z)]/100+ TR(z)

　　应用举例

　　下面是某未知物经检索后，工作站给出的前三个匹配度较高的可能的化合物。匹配度都在90以上，但保留时间相差较大。Gamma-terpinene的RI接近，最后选择未知物就是此化合物。

　　---------保留指数(RT)--分子量 (M) 匹配度(match quality)

　　未知物 ---------1254 136 -

　　gamma-terpinene 1249 136 93

　　Tricylene ---------1033---------136 91

　　delta-3-carene 1167---------136 91

　　未知物和三种化合物的质谱图比较：

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　　一般讲只要色谱柱(固定液)和柱温相同，就可以利用文献或手册发表的保留指数来定性。但必须在文献或手册给定的条件下，用一些已知组分先进行验证，确定其可信程度。通过使用了几种外面的保留指数数据，主要是极性WAX柱，非极性DB-1, DB-5柱子一般比较可靠。有时可能相差5-10个单位，但是是统一每个组分都相差这么多。当然，最好保留时间在自己的条件下测定，自己用。大家也许注意到许多发表的文献是除质谱鉴定外，并附有保留指数验证。

　　在NIST08中带约21，847个化合物的224，038个保留指数(极性和非极性柱)。便于质谱鉴定的确认。

1-5   

6-10   

11-15 

16-19 

一般C6—30就行，无问题。一般使用连续的正构烷，除非条件限制，无法得到时候，使用偶数或奇数的正构烷，有时候也使用连续和不连续的正构烷混合物。一般是购买正构烷混合物，比较方便。单个正构烷自己配制比较麻烦。

原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
一般C6—30就行，无问题。一般使用连续的正构烷，除非条件限制，无法得到时候，使用偶数或奇数的正构烷，有时候也使用连续和不连续的正构烷混合物。一般是购买正构烷混合物，比较方便。单个正构烷自己配制比较麻烦。

那关于进样的话，我样品采用的顶空手动进样，可以将稀释到0.01μg/μL的混标取50μL加入顶空瓶中平衡后吸附吗？我的样品是加了纯水的，需不需要在混标中加入相同mL的纯水？

是不是只要检测器不饱和正常出峰，稀释浓度对保留指数的计算并不会有很大的影响？

（我其实就是这么觉得的，但是没地方可以求证。多谢各位老师不吝赐教）

原文由 langtu009(Ins_96850f5a) 发表:

那关于进样的话，我样品采用的顶空手动进样，可以将稀释到0.01μg/μL的混标取50μL加入顶空瓶中平衡后吸附吗？我的样品是加了纯水的，需不需要在混标中加入相同mL的纯水？

是不是只要检测器不饱和正常出峰，稀释浓度对保留指数的计算并不会有很大的影响？

（我其实就是这么觉得的，但是没地方可以求证。多谢各位老师不吝赐教）

不用顶空进样，直接液体进样就行，液体进样的正构烷数据可以用于同样程序的顶空进样。顶空进样麻烦。

一般主要正常出峰，不是很小或很大就行。