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细胞总RNA提取
药物及主要试剂表1 药物及主要试剂
| 药物/试剂 | 生产公司 |
西达本胺 | 深圳微芯科技公司 |
胎牛血清 | Gibco |
RPMI Medium 1640培养基 | Gibco |
Waymouth’s培养基 | Gibco |
PBS | Solarbio |
HEPES | Solarbio |
TRIzol | Ambion |
氯仿 | 天津市北辰方正试剂厂 |
异丙醇 | 天津市北辰方正试剂厂 |
无水乙醇 | 天津市华东试剂厂 |
MonScriptTM RTLLL ALL-in-One Mix with dsDNase KitMonScriptTM ChemoHS qPCR MixKit | Monad |
表2
药物/试剂 | 生产公司 |
DNase/RNase-Free Water | Solarbio |
双抗 | Solarbio |
CCK-8 | MedChemExpress |
4%多聚甲醛 | Solarbio |
结晶紫 | Solarbio |
流式凋亡试剂盒 | BD |
DMSO | Solarbio |
REGμLAR AGAROSE G-10 | 上海贝晶生物有限公司 |
(1)细胞处理:
H446、DMS114:吸弃培养基,PBS清洗2次,吸弃PBS,培养皿斜立于冰上,将剩余PBS吸干。培养皿中加入1 mL trizol,迅速吹打混匀,充分裂解细胞,移入1.5 mL无酶EP管中。
H69、H526:细胞悬液放入15mL离心管中,900 rpm 离心8 min,离心后弃上清,PBS清洗2次,弃掉PBS,加入1mL trizol,迅速吹打混匀,充分裂解细胞,移入1.5 mL无酶EP管中。
(2)加入200 μL氯仿(每1 mL trizol),剧烈震荡混匀30 s,室温静置10 min。
(3)离心,4℃,12000 g,15 min。将水相转移至新的1.5 mL无RNA酶EP管中。
(4)在水相转移液中加入异丙醇,异丙醇:转移液=1:1,上下颠倒混匀30 s(或用
移液器上下抽吸混匀),室温静置10 min。
(5)4℃,12000 g,离心15 min,吸弃上清液。
(6)清洗RNA:在装有RNA沉淀块的EP管中加入1 mL预冷的75%乙醇(DEPC水:无水乙醇=1:3),轻微震荡,使沉淀漂浮起来,不要将RNA沉淀块弄碎。4℃ , 7500 rpm, 离心5 min,吸弃上清,再重复以上步骤2次。
(7)吸弃乙醇,将EP管再离心一次(4℃ , 7500 rpm, 离心2 min),用10 μL枪头尽量吸净剩余乙醇,将EP管水平静置于超净台内,干燥RNA至RNA团块变半透明状,吸取适量DEPC水溶解RNA沉淀,轻轻吹打,充分混匀,瞬时离心收集RNA于EP管底部(RNA溶解后立即置于冰上)。若不马上做逆转录,可将RNA保存于75%乙醇中。
(8)RNA浓度及纯度
用NanoDrop One检测RNA的浓度及纯度。具体操作如下:
a.清洗基座:开机后滴加1-2 μL去离子水于基座,浸泡10s,吸干水滴,重复三次。
b.空白校正:滴加1-2 μL DEPC水于基座上,放下检测臂,进行空白校正。
c.样本混匀:可用漩涡振荡器或手指轻弹方式混匀待检测的RNA样本(切记勿用枪头吹打或离心样品的方式混匀样本)。
d.检测样本:滴加1 μL混匀的RNA样本于基座,放下检测臂,检测样本。连续检测样本过程无需清洗基座,只需用无尘纸朝一个方向擦干基座即可。
e.清洗基座:RNA检测完成后清洗基座,步骤同第一步。
(9)反转录合成cDNA
具体合成步骤参照MonScriptTM RTLLL ALL-in-One Mix with dsDNase KitMonScriptTM ChemoHS q
PCR MixKit试剂盒。
a.反转录试剂盒中各试剂解冻,并置于冰上。
b.轻弹各试剂并轻度离心。
c.按照下表于EP管中添加反转录试剂。
d.瞬时离心,上机温育,程序设定为37℃ ,2 min(去除基因组DNA污染)→ 55 ℃ ,15 min → 85℃ ,5 min(终止反应)→ 4℃,∞,得到cDNA。反转录生成的cDNA放入- 20℃冰箱保存,若想更长时间保存可放入- 80℃冰箱。