主题:【讨论】请各位老师帮我看看多肽质谱出现这样的情况是什么原因

浏览0 回复13 电梯直达
阿怪
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我有一个多肽样品,分子量为1153.67,在7.5min分钟出峰,液相紫外图如下:

质谱图如下:



这组质谱峰判断为[M+2H]2+,与我们化合物的精确分子量和同位素丰度都匹配


看到这组峰我就有点迷茫了,这组峰带3个电荷,难道是[2M+3H]3+?如果是这个情况的话,精确分子量和同位素丰度也是匹配的。

看到这组我就看不懂了,既不像是[M+H]+,也不像是[2M+4H]+,中间丰度较低的1732.01,1733.01,1734.01等看不出是怎么形成的,如果是噪音的话好像也没道理这么大。

各位老师专家有明白的请教我一下!非常感谢!
该帖子作者被版主 happy爱米粒2积分, 2经验,加分理由:很详细的描述,辛苦了
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netsking
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会不会是另有杂质啊?感觉象是有一丰度比较低的多肽化合物.
阿怪
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谢谢netsking老师,我也怀疑过有类似加氢的杂质,但是1.如果把小峰当成是杂质,那么剩下丰度高的一组峰同位素丰度比仍然是不对的,2.如果有这类杂质,866这个地方仍然应该看得出来这个杂质
zdqzxy
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能不能给个仪器参数设置,流动相信息,色谱柱信息,学习下
阿怪
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phillyrin
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感觉就应该是杂质来的,另外能不能放数据文件出来看看。这么看比较费劲……
maldiguy
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质谱图很好解释,但液相就不好说了
867为2加,1733则是1价
1155是3价,1733是2价
这样,我们看到的1733是由两种不同成分构成的
yzulcl
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这张图里面的1731.51,毫无疑问是已知多肽的 [M+H]+ 单同位素峰,多肽的单同位素分子量 1730.51,这样 [M+2H]2+  就是 866.26,[2M+3H]3+  就是 1154.67。都能对应。

楼主的疑问就在这张图里面的 1732.01、1733.02、1734.01 等峰,要一眼看清楚不容易。
我们先假设这是另一个物质的 [M‘+H]+ 峰,那么分子量就是 1731.01,比已知的 1730.51 多 0.5,会是什么呢?不好办。
再假设是某物质的 [M‘+2H]2+ 峰,同位素峰之间间隔 0.5,正好有一半的同位素峰与已知物的峰重叠了,这样,这个某物质的  [M‘+2H]2+ 的单同位素峰就有可能是 1731.51 或者 1732.01 两个可能。于是,这个某物质的 M’ 的分子量就可能是 3461.02 或者 3462.02。我们算算:已知多肽的 2M 是多少? 1730.51*2 = 3461.02。找到了!
于是,我们可以确认:这张图里面看似多出来的 1732.01 等峰,其实是已知多肽的 [2M+2H]2+ 峰,同位素峰间隔 0.5,只不过有一半的峰正好与 [M+H]+  峰位置一样,被覆盖了。
yzulcl
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其实,这张图上,还可以看到 [3M+3H]3+ 的峰,只不过信号特别小罢了。

另外,赞一下楼主的多肽样品,纯度挺高。再赞一下高分辨液质联用的方法,液相分离得好,质谱图也好。

不知楼主能否透露一下,在哪里做的LCMS实验吗?
阿怪
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原文由 yzulcl(yzulcl) 发表:
其实,这张图上,还可以看到 [3M+3H]3+ 的峰,只不过信号特别小罢了。

另外,赞一下楼主的多肽样品,纯度挺高。再赞一下高分辨液质联用的方法,液相分离得好,质谱图也好。

不知楼主能否透露一下,在哪里做的LCMS实验吗?

谢谢参与讨论,液质是我自己做的。
yjihicvtkd
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老师们,我现在也在做一个多肽的纯化,先是样品液过液相色谱柱,收集的峰拿去打质谱
但是对于图如何解析却无从下手!!
我的目标多肽是472 6分子量,43个氨基酸,其中8个半胱氨酸,
这是其中收集的一个峰打出的质谱图,大家帮看看怎么解谱呢???怎么判断是不是我要的多肽呢?
该帖子作者被版主 xgy20052积分, 2经验,加分理由:建议另开新帖,便于讨论
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