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主题：【已应助】质谱数据如何相对定量？

浏览0 回复15 电梯直达
kuerten110
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发表于：2014/03/04 14:52:24 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我们打算开展组学实验，前阵子我们弄了些细胞脂质提取物（细胞有2种，正常的和基因突变的，我们各提取了相同数量的细胞的脂质），找人用AB的TOF 5600做了LC-MS，用lipidview软件分析能发现检测到上万种不同的脂类，我们想看看哪些脂质含量发生了变化，analyst和lipidview软件我们都有，因为我们没有用任何标准品（目前只是想先看看哪些脂类含量发生了变化），我们现在不知道该如何进行组间相对定量，有哪位老师知道这样的数据该怎么相对定量吗？（就是能找出2组样本中含量有差异的就行）
先谢谢大家了！
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八杯水
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2014/3/4 15:32:58 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
好高级，不明觉厉。
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八杯水
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2014/3/4 15:37:49 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
（就是能找出2组样本中含量有差异的就行）？？
那同一条件下，对比同样进样量的峰面积或者离子丰度不就可以了吗？回答得太简单，别见笑啊。
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kuerten110
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2014/3/4 16:28:01 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 八杯水(djj85411) 发表:
（就是能找出2组样本中含量有差异的就行）？？

那同一条件下，对比同样进样量的峰面积或者离子丰度不就可以了吗？回答得太简单，别见笑啊。


首先谢谢您的回答，这个机器给的数据我用lipidview分析后可以选择是peak intensity 或者是peak area，但是有个人给我讲说这个出来的是质谱峰强度，不是那个真正的物质含量，说要是定量还得去还原那个液相的数据，是这样吗？
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八杯水
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2014/3/4 17:01:30 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 kuerten110(v2788286) 发表:
原文由 八杯水(djj85411) 发表:
（就是能找出2组样本中含量有差异的就行）？？

那同一条件下，对比同样进样量的峰面积或者离子丰度不就可以了吗？回答得太简单，别见笑啊。


首先谢谢您的回答，这个机器给的数据我用lipidview分析后可以选择是peak intensity 或者是peak area，但是有个人给我讲说这个出来的是质谱峰强度，不是那个真正的物质含量，说要是定量还得去还原那个液相的数据，是这样吗？


同一条件下，同一个物质的峰强度难道不是跟该物质的含量成正比关系吗？
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kuerten110
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2014/3/4 17:57:41 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我也是这样认为，但是我又一次打听了一个工程师，他给我的答案是否定的，我不是化学出身的，所以感觉疑惑，才来问高手的
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ie4680180
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2014/3/4 19:06:55 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
要是有个内标就好了。呵呵
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kuerten110
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2014/3/4 23:01:17 7楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
是这样，我们的目的是先看看有多少表达有差异的脂质，算是大海捞针啊，内标根本就没法加，总不能加上万种吧？哎，要是那个峰强度或者是峰面积能代表相对量是多少就好了。
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2014/3/4 23:14:47 8楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
哦，是这样啊。
峰强度或者峰面积为什么不能代表相对量是多少？我们平时定量都是根据他们来的啊。
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netsking
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2014/3/5 3:09:36 9楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 八杯水(djj85411) 发表:
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原文由 八杯水(djj85411) 发表:
（就是能找出2组样本中含量有差异的就行）？？

那同一条件下，对比同样进样量的峰面积或者离子丰度不就可以了吗？回答得太简单，别见笑啊。


首先谢谢您的回答，这个机器给的数据我用lipidview分析后可以选择是peak intensity 或者是peak area，但是有个人给我讲说这个出来的是质谱峰强度，不是那个真正的物质含量，说要是定量还得去还原那个液相的数据，是这样吗？


同一条件下，同一个物质的峰强度难道不是跟该物质的含量成正比关系吗？


这个问题的答案如上说的, 是也不是. 由于样品每次进样的离子化都会引起不同的向应, 所以同一样品不同的进样出来的结果就有差异. 最好的方法是假内标, 所有的信号都与内标比就可以了
该帖子作者被版主 djj85411加 3积分， 2经验，加分理由：讨论
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kuerten110
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2014/3/5 9:06:25 10楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 netsking(netsking) 发表:
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那同一条件下，对比同样进样量的峰面积或者离子丰度不就可以了吗？回答得太简单，别见笑啊。


首先谢谢您的回答，这个机器给的数据我用lipidview分析后可以选择是peak intensity 或者是peak area，但是有个人给我讲说这个出来的是质谱峰强度，不是那个真正的物质含量，说要是定量还得去还原那个液相的数据，是这样吗？


同一条件下，同一个物质的峰强度难道不是跟该物质的含量成正比关系吗？


这个问题的答案如上说的, 是也不是. 由于样品每次进样的离子化都会引起不同的向应, 所以同一样品不同的进样出来的结果就有差异. 最好的方法是假内标, 所有的信号都与内标比就可以了


您好，非常感谢您的回答，这个假的内标该如何找呢？有什么要求吗
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