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主题：【已应助】MZmine的相关资料和教程，谢谢啦

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发表于：2021/09/16 10:37:50 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
下完软件之后一片懵啊，哪位有教程说明书，可以分享一下就谢谢啦
推荐答案：歪果仁zZ回复于2021/09/16
提到代谢组学峰比对，不得不提到一款老牌的比对软件，它就是MZmine2。它发表于2010年，前身是MZmine，发表于2006年，可谓是十分经典的一款代谢组学峰比对软件。

MZmine 2的功能有很多，它是一款基于JAVA开发的开源软件，可以用于处理代谢组学profile数据，并且具有可视化和很多的分析功能。 MZmine 2的一部分功能基于R，所以首先需要安装R环境，并且安装一些依赖包： install.packages(c("Rserve", "ptw", "gplots", "baseline", "hyperSpec","ggplot2")) source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("xcms") biocLite("CAMERA") biocLite("PROcess") 运行mzmine并导入数据

推荐看一下这个网站：https://www.sohu.com/a/455056062_121060591
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2021/9/16 14:00:53 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
这个是什么软件。
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hujiangtao
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2021/9/16 14:43:21 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
这是代谢组学分析方面的软件，网上搜一搜看看有没有教程，或者求助一下生产高分辨质谱的厂家工程师
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2021/9/16 14:49:23 Last edit by hujiangtao
歪果仁zZ
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2021/9/16 20:21:45 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
提到代谢组学峰比对，不得不提到一款老牌的比对软件，它就是MZmine2。它发表于2010年，前身是MZmine，发表于2006年，可谓是十分经典的一款代谢组学峰比对软件。

MZmine 2的功能有很多，它是一款基于JAVA开发的开源软件，可以用于处理代谢组学profile数据，并且具有可视化和很多的分析功能。 MZmine 2的一部分功能基于R，所以首先需要安装R环境，并且安装一些依赖包： install.packages(c("Rserve", "ptw", "gplots", "baseline", "hyperSpec","ggplot2")) source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("xcms") biocLite("CAMERA") biocLite("PROcess") 运行mzmine并导入数据

推荐看一下这个网站：https://www.sohu.com/a/455056062_121060591
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2021/9/17 9:49:38 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
希望对你有帮助
附件：
mzMine Tutorial sm - SourceForge.pdf
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2021/12/30 10:48:15 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 歪果仁zZ(v3255306) 发表:
提到代谢组学峰比对，不得不提到一款老牌的比对软件，它就是MZmine2。它发表于2010年，前身是MZmine，发表于2006年，可谓是十分经典的一款代谢组学峰比对软件。

MZmine 2的功能有很多，它是一款基于JAVA开发的开源软件，可以用于处理代谢组学profile数据，并且具有可视化和很多的分析功能。 MZmine 2的一部分功能基于R，所以首先需要安装R环境，并且安装一些依赖包： install.packages(c("Rserve", "ptw", "gplots", "baseline", "hyperSpec","ggplot2")) source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("xcms") biocLite("CAMERA") biocLite("PROcess") 运行mzmine并导入数据

推荐看一下这个网站：https://www.sohu.com/a/455056062_121060591
想问下这里提到的配置文件是什么啊
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lijing320323
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2022/1/2 23:51:42 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
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2023/5/8 18:09:09 7楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
感谢大佬指点
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