主题:【第十三届原创】应用MassHunter的未知物分析处理香气样品数据

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symmacros
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应用MassHunter的未知物分析处理香气样品数据



香气样品或香精样品数据往往比较复杂,组分多,数据处理一般比较耗时费力。有自动化的数据处理就比较好了。下面简单介绍应用MassHunter的未知物分析来进行处理香气样品数据。

1 界面布局

打开软件,桌面快捷方式或程序栏打开。

版本7.0的界面,以菜单形式出现,有工具栏。



版本10.1的界面,和版本7.0的界面不同,菜单的编辑,分析,报告没有了,取而代之是首页菜单。帮助菜单变成了右上角的“?”。



自定义快速访问工具栏设置打开主菜单下面的子菜单选项类似MS Office。



2 新建分析和打开分析

软件使用前,必须先建立新的分析或调出已经保存的分析后,才能进行相关的方法设置,进行分析,打印报告等,否则这些菜单都是灰色的。

在文件菜单—新建分析,例如ua_test1.uaf。添加样品,浏览与复制样品,添加所要分析的样品数据文件。可以选择本机的数据文件或从MassHunter的定量分析导入样品数据。

或者打开已经存在的分析项目,添加或删除样品。



3 方法设置

在使用之前,需要对检索方法进行相应的设置。在方法菜单—方法编辑,解卷积,谱库检索,化合物识别,目标匹配,版本10.1增加峰检测,而版本7.0是把峰检测放在解卷积里面,空白扣除。

版本10.1的谱库检索多了“正反向搜索”,“纯加权因子”。

在方法菜单进行建立新方法,编辑方法,调用方法和保存方法。



解卷积参数一般默认就行;谱库检索,浏览谱库选择谱库文件,可以添加多个谱库,按顺序检索。谱库类型包括*.mslibrary.xml、*.mslibrary(二进制)或 PCDL *.cdb 或 ChemStation *.L 谱库;化合物识别里面最小匹配因子,即匹配度,对检索化合物的个数影响很大。默认是50,感觉80可以过滤掉很多不确定的识别峰;目标匹配默认就行。

4 分析数据

一旦建立了分析方法,就可以进行全面分析或全部分析,全自动进行解卷积、谱库检索、空白扣除和目标匹配。软件会显示各个过程的进度,完成全面分析。也可以进行解卷积、谱库检索、空白扣除和目标匹配的单项分析。



自动分析结束,组分表会出现在软件界面的左下角区域。



共1114个组分,231匹配。可以看出来未知物分析软件的解卷积功能很强,逐一拆分后进行检索,并且不需要解卷积数据库。可以逐一核对匹配情况来删掉匹配不佳的化合物。

5 布局设置

视图—预设布局--标准,版本7.0和版本10.1的布局是一样的。



视图—预设布局—全部--扩展,显示“样品”、“色谱图”、“组分”、“质谱图”、“离子峰”和“分子结构”窗口。



在版本7.0上面,左面上面是样品信息,模式是样品名称,文件名,组分,匹配数。



可以在左面样品的任何区域右击鼠标,添加或删除列,例如添加仪器类型,样品其它信息等。清除样品结果,删去样品,打印等功能。



左下面区域是组分信息。可以在左面组分的任何区域右击鼠标,添加或删除列,例如添加组分峰面积,CAS号码等其它信息。 删除化合物,打印等功能。

导出CSV文件。







右边区域从上到下依次是总离子色谱图TIC,组分质谱图,谱库质谱图,最下面是离子峰,EIC峰和分子结构。在版本7.上面有组分扫描SCAN的粗离子质谱图,即未进行解卷积前的离子情况。而版本10.1没有看到这个。

分析完成后,要对结果进行保存—保存分析。

6 生成报告



7多样品分析或批处理分析

可以一次添加多个样品进行分析或全分析。



(下篇:MassHunter的未知物分析—解卷积效果考察)
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symmacros
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cxshui
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1 未知物解析功能,感觉匹配度80的时候很多物质都不太对的上了,我一般设置里选80,但是自己会根据实际情况进行删减;
2 另外,不知道老师有没有注意到,这个软件给出的组分面积有时候不太准——比如两个物质出峰时间基本一致,经过提取离子大概估算峰面积1:1,但是未知物解析软件给出的峰面积比可能是1:4这样;
3 之前还遇到过一个问题,色谱图上响应挺高的峰,工作站直接定性匹配度也高,但是用这个未知物解析,它直接把这个物质漏掉了,不知道是什么原因
该帖子作者被版主 jimzhu4积分, 2经验,加分理由:参与讨论。
之宣
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原文由 cxshui(cxshui) 发表:
1 未知物解析功能,感觉匹配度80的时候很多物质都不太对的上了,我一般设置里选80,但是自己会根据实际情况进行删减;

非常感谢参与讨论,我赞成设置匹配度80或以上,减少假阳性结果。

2 另外,不知道老师有没有注意到,这个软件给出的组分面积有时候不太准——比如两个物质出峰时间基本一致,经过提取离子大概估算峰面积1:1,但是未知物解析软件给出的峰面积比可能是1:4这样;

我也发现未知物分析的面积比和其它软件里得到的比例不一样,我有时间进一步看看,再和你探讨。

3 之前还遇到过一个问题,色谱图上响应挺高的峰,工作站直接定性匹配度也高,但是用这个未知物解析,它直接把这个物质漏掉了,不知道是什么原因

我也曾经遇到过这种情况,看见不小的峰,但未知物分析没有认出来,当时没有仔细看看,我找找那个样品再看一下是什么原因。好些峰宽了一些什么的,我记不清楚了。

凯子蒸包子
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朱老师,您好!方便把MSLIBRARY等检索谱库发我吗?我发现我的软件里没有。89692176@qq.com,非常谢谢!
symmacros
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原文由 凯子蒸包子(zk19831125) 发表:
朱老师,您好!方便把MSLIBRARY等检索谱库发我吗?我发现我的软件里没有。89692176@qq.com,非常谢谢!


你可以用NIST库检索。
凯子蒸包子
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原文由 symmacros(jimzhu) 发表:

你可以用NIST库检索。
MASShunter的检索数据库跟NIST的不匹配
凯子蒸包子
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原文由 symmacros(jimzhu) 发表:

你可以用NIST库检索。
想用MSHUNTER进行未知物检索,但工作站数据不能导入AMDIS。尝试用MSHUNTER自带的DEMO.L,检索出的化合物明显比用AMDIS的少。估计DEMO.L数据库不全吧,是否有完整的数据库?
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原文由 凯子蒸包子(zk19831125) 发表:
想用MSHUNTER进行未知物检索,但工作站数据不能导入AMDIS。尝试用MSHUNTER自带的DEMO.L,检索出的化合物明显比用AMDIS的少。估计DEMO.L数据库不全吧,是否有完整的数据库?
demo大概有十几个化合物。
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原文由凯子蒸包子(zk19831125)发表:
原文由 symmacros(jimzhu) 发表:

你可以用NIST库检索。
MASShunter的检索数据库跟NIST的不匹配
你要选择谱库检索。
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