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pbm反向匹配
是的,pbm反向匹配。
计算正向检索(标准库的峰与未知谱对照,看看谱库中是否存在与未知谱相同的参考谱图)的相似系数,即匹配概率或匹配率(匹配度)。计算反向检索(未知谱的峰与标准库对照,看看标准谱中的各质量峰是否出现在未知谱中。忽略在谱库不存在的未知谱上的峰。)的相似系数,即匹配概率或匹配率(匹配度)。
这个匹配概率(possibility)是通过统计计算来的。曾经在一般英文书上看到,记不清了。也源于未知谱和谱库谱图之间矢量的角的余弦。
在NIST检索中匹配率最大为1000(相当PBM中100)。最好的结果是999,无峰的谱图是0。一般讲,900或更高,极好匹配; 800-900,良好匹配;700-800,尚可;低于600,差。
对正向检索来讲,任何峰只要在未知谱或标准谱中之一出现,都会降低匹配值。对反向检索而讲,任何峰只要在标准谱出现,而未知谱中没有,也会降低匹配值。
如果正向的匹配率低,反向的匹配率高,说明未知峰谱可能是混合物的谱图,或者本底干扰严重。
PBM检索也属于反检索。PBM按各个质谱的重要性和唯一性(由检索目录决定),丰度(0-100分组),并结合
分子式计算,氮规则,同位素簇模样,合理丢失,丢失中性碎片等参数进行比较,筛选比较,比较后计算相似系数。PBM检索是一种谱库检索技术(检索程序),它可以将未知化合物的质谱和参比(标准)质谱库进行比较。MSD 化学工作站的检索流程使用基于概率匹配(PBM=probability-based matching)的算法,该算法由康奈尔大学的 Fred McLafferty 教授及其合作者共同开发。PBM 检索验证在未知质谱中是否存在参比质谱的主峰,以此来识别参比谱库中与未知化合物最相似的质谱。该算法叫做反检索,即使样品光谱包含有共流化合物,算法也能在谱库中检索到相应光谱。质谱的相似性通过称为匹配质量的量来衡量。
这种算法使用反向检索来检验未知谱中是否含有参照谱中的峰。未知谱中多余的峰被忽略,因此可以进行多种化合物的混合物谱图解析。
由于质谱中各种质荷比 (m/z) 值出现的几率不同,PBM 算法同时利用质量数和丰度值来确认参照谱中最显著的峰。谱图加入谱库后,这些峰用来产生用于 PBM 检索例程的压缩参照谱。
然后检索例程中的预过滤器给未知谱中每个峰赋以显著的值,用来查找压缩参照谱库中最可能的匹配。接着使用上述的反向检索将所选的压缩谱同完整的未知谱进行对比。预过滤器可以立即排除数据库中约 95% 的化合物,从而大大加快了检索速度(使用默认策略参数时)。