主题:【已应助】GC-MS 和LC-MS前处理除了衍生化外,其他步骤一样吗?

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做的非靶向代谢组学,对同一个物质同时使用LC-MSGC-MS检测,在不同的文献中分别找到了这个物质的LC-MS前处理和GC-MS 前处理,有一个问题就是两篇文献中对代谢物的提取方法除了GC-MS前处理需要衍生化以外,在衍生化之前的代谢物提取步骤也不同。这样的话我可以按照两个方法来做吗,还是说LC-MSGC-MS的前处理一样,只是对GC-MS的前处理加一个衍生化?
两个方法步骤如下:

1、取样品30mg放入1.5mlEP管→加入两个4mm钢球→加入20μL内标→加入600μL甲醇:水(4:1)→-80℃,放置2min→60HZ超声2min→加入120μL氯仿→剧烈涡旋→环境温度下超声提取10min→4℃放置10min→4℃,13310g离心10min→取上清,冻干→衍生化

2、取样品60mg放入1.5mlEP管→加入200μL水,涡旋2min→加入800μL甲醇:乙腈(1:1,含内标)→涡旋2min→两次低温超声处理(30min)→-20℃放置1h→4℃,14000g离心20min→取上清,冻干
推荐答案:xiaogumd11回复于2023/07/07
两个方法步骤有差异,方法1用到了氯仿,做为提取液体,再冻干。方法1相当于直接冻干法。两个方法的效果是否相同,楼主可以做实验比较。
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xiaogumd11
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两个方法步骤有差异,方法1用到了氯仿,做为提取液体,再冻干。方法1相当于直接冻干法。两个方法的效果是否相同,楼主可以做实验比较。
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原文由 xiaogumd11(v3247983) 发表:
两个方法步骤有差异,方法1用到了氯仿,做为提取液体,再冻干。方法1相当于直接冻干法。两个方法的效果是否相同,楼主可以做实验比较。
第2个方法做了,检测结果不好,目前打算试一下第一个方法,但是我有一个疑问,用到氯仿,是不是就是主要针对脂质的提取,检测结果会不会大部分都是脂质类,因为我想做的事非靶检测,用这个方法的话感觉是重点关注脂质类,这样处理合理吗?
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